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芯片数据中的RMA作图细节
2013-12-18 12:37
这个细节,是转换坐标轴上文字的方向,虽然是很小的问题,也花费了一些时间,惭愧。 方案: 1. from ky pdf(after-normalization.pdf,width=4+dim(data2) ]/5,height=6) palette(c(#dfeaf4,#f4dfdf,#AABBCC)) par(mar=c(2+round(max(nchar(sampleNames(data)))/2),4,2,1)) title - paste ...
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表达谱芯片的基本数据处理流程-R
热度 1 2013-12-18 12:34
1. 载入各种包 source(http://bioconductor.org/biocLite.R) biocLite(affy) biocLite(hgu133plus2probe) biocLite(hgu133plus2.db) biocLite(hgu133plus2cdf) biocLite(DBI) library(affy) library(Biobase) library(BiocGenerics) library(affy) library(Biobase) library( ...
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