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开源软件中的问题地图列举,小心有坑,做好甄别!
庄伟 2020-11-7 11:58
需要小心使用的可能的问题地图包: R:maps,spData,mapdata 尤其是画带有其他邻国的疆域图时,更加需要注意,因为像maps这种包里面的世界地图画的国境线是有问题的,当我们放大到我们的研究区域时,这种错误就很明显了,可以看看例1中的问题地图。 在开源软件中一定要 ...
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如何避免问题地图的坑
热度 1 庄伟 2020-11-7 11:47
如何识别问题地图: 请参照自然资源部发布的文章,《如何识别问题地图》:mnr.gov.cn/dt/ywbb/201908/t20190802_2451218.html 期刊论文中问题地图: 在论文期刊中,会看到一些问题地图,没有画完整,出现比较多的问题是 藏东南的国境线。 而这些问题,不仅仅是出自一些国外研究者,国内的研究者发布的论文 ...
426 次阅读|1 个评论 热度 1
推荐一款可以替代Endnote的文献管理软件 Zotero
庄伟 2020-10-27 11:51
Zotero是一款开源免费的文献管理软件,相比收费的Endnote,它更加轻巧灵活。我以前一直是使用Endnote,从这个月开始正式使用Zotero了,发现了它能够胜任,而且有些功能超过了Endnote。 简洁的页面,注意word使用时,需要同时打开Zoreto。 下载和使用方法,大家可以从官网和其他网站找到: https://www.zotero. ...
个人分类: 我的文献库|470 次阅读|没有评论
Use R: 画泰勒图 Taylor Diagram,模型比较一目了然
庄伟 2020-10-14 22:54
IPCC推荐的模型评价方法: 在做模型相关的工作时,我们经常会需要比较模拟效果。当使用多个模型时,看那个模型的模拟效果更好些,模拟误差更小,仅仅画散点图进行比较是不直观的。Taylor Diagram 泰勒图是一种可以直观进行模型比较的方法。它巧妙利用三角函数几何原理,把三种评价模型的指标在一张图上展现。IPCC的报告 ...
个人分类: R|727 次阅读|没有评论
USE R 画出散点密度图
热度 1 庄伟 2019-11-6 16:24
有三种方法 一种如下: 可以用第一个文件中的代码生成图例。这样方法用R里面基本的画图功能,有些格式要自己调整。图例不能自己生成,需要出图后,自己修改。 r_scatter_density_plot.R 这是第二种方法 借助ggplot 不过这个示例中,如何画出图例,需要思考一下,有待解决 r_scat ...
个人分类: R|1469 次阅读|2 个评论 热度 1
Penman-Monteith模型模拟蒸散R代码示例
庄伟 2019-10-28 09:34
运行代码在下方zip附件中,请下载:) PM_HowardSprings_20190918.zip
个人分类: R|1138 次阅读|没有评论
Century 模型 R代码分享
庄伟 2019-8-30 13:45
Century 是传统的土壤碳过程模型,这里分享本人最近找到的三个相关版本: 1. Fortran 版本(linux) 该版本的下载地址: https://github.com/bsulman/INTERFACE-model-experiment-synthesis DAYCENT.zip Sulman et al (2018)发表了多个土壤碳模型比较的文章,并分享了部分模型的代码,century的源代 ...
个人分类: R|1958 次阅读|没有评论
USE R: SCEUA优化方法进行Shuttleworth-Wallace 模型的参数优化
庄伟 2019-7-9 17:02
sceua_SW.zip 分享一个SCEUA进行参数优化的例子,模型是Shuttleworth-Wallace 模型,其中的冠层导度子模型采用自Leuning et al. (2008) WRR. 用到了Ozflux一个站点的数据,数据为白天的日均值,优化的参数是最大气孔导度gmax,和土壤表面阻力有关的参数b3。感兴趣的老师同学可以看看。这里写的R代码是在j ...
个人分类: R|1454 次阅读|没有评论
气孔导度单位换算 更正
庄伟 2019-7-4 22:57
气孔导度(stomatal conductance)是计算植被蒸散常用的变量。气孔导度的单位,气象中一般采用mm s -1 (或者 m s -1 ),生理生态中一般采用 mmol m -2 s -1 (或者mol m -2 s -1 )。从m s -1 到的mol m -2 s -1 单位换算,需要乘以摩尔体积的倒数(1/V m , mol m -3 )。 根据下图的理想 ...
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【code分享】 USE R: 参数的全局优化算法
庄伟 2019-5-23 20:04
Shuffled Complex Evolution (SCE-UA) Method SCE-UA, 是一种全局优化算法, 它结合了随机搜索算法、单纯形法、聚类分析及生物竞争演化等多种方法的优势,能有效解决目标函数反映面存在的粗糙、不敏感区及不凸起等问题,并可避免局部最小点的干扰 。该方法能够同时优化模型中的多 ...
个人分类: 科研工具|1905 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2020-11-24 09:20

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