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R语言循环第三境界:purrr包map函数!
邓飞 2021-6-10 21:28
1. 三境界 R语言写循环有 三境界 : 手动for循环 apply系列 purrr泛函式编程 其中,手动for循环我最常用,apply系列半吊子,purrr函数越用越趁手,这里介绍一下purrr编写循环的方法。 2. 泛函式函数 「泛函式定义:」 ❝ 函数的函数称为泛函式,map(x,f)中,map是函数,f也是 ...
个人分类: 农学统计|291 次阅读|没有评论
混合线性模型的可视化
邓飞 2021-6-5 17:29
1. 数据 这里使用 sleepstudy 数据集,看一下免费的R包 lme4 和付费包 asreml 如何处理不同的混合线性模型,以加深对混合线性模型的理解。 「数据描述:」 ❝ 睡眠剥夺研究中受试者每天的平均反应时间。第0天,受试者有正常的睡眠时间。从那天晚上开始,他们每晚只能睡3个小时,依次进行0~9天。观察结 ...
个人分类: 农学统计|532 次阅读|没有评论
混合线性模型的理解 | 学霸和富二代的故事
邓飞 2021-6-5 17:28
富二代和学霸的故事 看一下 lmer 函数拟合混合线性模型的通用函数: 举个例子,在一个课堂上,小学六年级,班里面有30个学生,这些学生有一年级到五年级的学习成绩,现在根据这些数据,预测这些学生六年级的成绩。 「学生分类:」 富二代,富二代家里有钱,幼儿园和小学都有私人教师,个性化补习,起点较高 ...
个人分类: 农学统计|508 次阅读|没有评论
文献下载文献阅读的方法分享 | 我的三板斧
邓飞 2021-6-5 17:27
这几天在新疆培训,沟通起文献下载文献阅读的方法,这里我分享一下我的三板斧。 1. 搜索文献 1.1 百度学术 「推荐指数:」 *** 文献下载,或者关键词查询,可以用 百度学术 :https://xueshu.baidu.com/ 在这里插入图片描述 搜索一篇文献之后,如果有pdf链接,可以直接打开下载: 现在百度学术, ...
个人分类: 杂谈|515 次阅读|没有评论
用最酷的方法学习R语言
邓飞 2021-6-5 17:18
1. 看大神怎么说 前几天去新疆培训,制作了R语言的基础教程,在翻阅资料时,看到了 知乎张敬信 关于R学习的观点,很是赞同。 张敬信老师写了一本书 《R语言编程--基于tidyverse》 ,网址:https://github.com/zhjx19/introR 下面几段是书中的话: ❝ 国内的R语言博客、教材大多数都很落后。初学R语言 ...
个人分类: R语言|528 次阅读|没有评论
如何安装GWAS分析软件R包:GAPIT
邓飞 2020-10-24 13:14
「太长不看版」 在R中运行下面命令即可安装成功PAPIT软件。 #安装GAPIT软件做GWAS分析 if (!requireNamespace( BiocManager ,quietly=TRUE)) install.packages( BiocManager ) source ( http://zzlab.net/GAPIT/GAPIT.library.R ) source ( http ...
个人分类: 农学统计|3320 次阅读|没有评论
机器学习路线图
邓飞 2020-10-22 21:57
之前,在公众号上写了一个专辑《进军机器学习》,时间跨度两年了,还是学学停停,同样学习的朋友都已经到 「深度学习」 、 「神经网络」 、 「强化学习」 了,而我还在机器学习的门口左右徘徊。关于机器学习的学习,我有很多经验,因为我深深的知道 「不花钱是不能够学到东西的,毕竟充值才能让你变强」 的道理,我也知道 ...
个人分类: 机器学习|1091 次阅读|没有评论
R语言中的方差分析汇总
邓飞 2020-10-21 22:08
方差分析,是统计中的基础分析方法,也是我们在分析数据时经常使用的方法。下面我总结一下R语言如何对常用的方差分析进行操作。 1. 方差分析的假定 上面这个思维导图,也可以看出,方差分析有三大假定:正态,独立和齐次,如果不满足,可以使用 广义线性模型 或者 混合线性模型 ,或者 广义线性混合模型 去分 ...
个人分类: R语言|2876 次阅读|没有评论
分类变量logistic回归分析--1
邓飞 2020-9-23 23:13
1. 二分类logistic回归分析 概念解释 「logistic回归介绍:」 Logistic回归适用于二分类变量(0和1)。模型假设Y服从二项分布,线性模型的拟合形式为: 「什么是优势比(odds radio)」 其中 为Y=1时的优势比。 「什么是对数优势比」 其中 为对数优势比,也称logit。 「什么是 ...
个人分类: 农学统计|2367 次阅读|没有评论
R语言tryCatch使用方法:判断Warning和Error
邓飞 2020-9-22 19:48
1. 出门掉坑里 因为一些情况,需要判断一行命令运行的状态,然后再做出反应,整体来说: 是否出现warning,出现了怎么处理? 是否出现Error,出现了怎么处理? 没有出现怎么处理? R中判断warning和error状态的函数,我没有找到。一个玩 Java 的同事说, try.....catch 多经典的方法,你怎么不用呢? ...
个人分类: R语言|3097 次阅读|没有评论

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