TAIR
The Arabidopsis Information Resource
http://www.arabidopsis.org/
1 在TAIR主页,把鼠标放在工具栏“Tools”标签下,滑动鼠标至该标签弹出列表的“Bulk Data Retrieval”处,点击该标签,进入“Bulk Data Retrieval and Analysis”页面,网址:
http://www.arabidopsis.org/tools/bulk/index.jsp。
2 在上一步页面点击蓝色标签“Sequences”,进入“Sequence Bulk Download and Analysis”页面,网址:
http://www.arabidopsis.org/tools/bulk/sequences/index.jsp。
3 在上一步页面的“Locus/Gene Model Identifiers or Sequences”文本框输入基因号列表,可以以空格分隔基因号,或每行一个基因号。例如“At1g01010 At1g01020 At1g01030”。
4 在“Dataset”下拉列表中选择需下载序列的类型,可以是以下14种:
- AGI transcripts
- AGI coding sequences
- AGI genomic locus sequences
- AGI protein sequences
- TAIR10 Loci Upstream Seq - 500bp
- TAIR10 Loci Upstream Seq - 1000bp
- TAIR10 Loci Upstream Seq - 3000bp
- TAIR10 Loci Downstream Seq - 500bp
- TAIR10 Loci Downstream Seq - 1000bp
- TAIR10 Loci Downstream Seq - 3000bp
- Intergenic Sequences
- Intron Sequences
- AGI 3' UTRs
- AGI 5' UTRs
5 点击“Get Sequences”按钮,即可获得需下载的序列。
https://blog.sciencenet.cn/blog-656335-654648.html
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