||| |
Hi-C和捕获Hi-C是研究基因组三维组织的技术,HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C(Capture Hi-C,CHi-C)产生的测序数据的流程。
流程比对数据到一个指定参考基因组,并去除可能阻碍随后分析的假象。HiCUP也产生一个易于解释,但详细的质控(quality control,QC)报告,它帮助改善实验方案以用于未来研究。
下载:http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/hicup/
语言:Perl
时间:20151120
参考:HiCUP: pipeline for mapping and processing Hi-C data
Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
GMT+8, 2024-10-20 00:27
Powered by ScienceNet.cn
Copyright © 2007- 中国科学报社