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800人民币搞定CRISPR基因编辑DIY

已有 6803 次阅读 2016-9-27 08:52 |系统分类:海外观察

昨天在网上看到这个消息,一个原来在一家政府实验室工作名叫 Josiah Zayner 的小伙子,辞职开了家叫 ODIN 的公司,出售 120美金一套的 CRISPR基因编辑 DIY 工具盒。YOUTUBE上他的客户在兴奋地分享实验结果。Zayner 博士 (芝加哥大学生物化学与生物物理) 说他的理念是把基因编辑平民化:不需要学过分子生物、听说过DNA就行。


ODIN 大家应该知道的,是北欧以及日耳曼神话里的一个 pagan 大神。Zayner 给他公司取这个名字有点意思。ODIN 公司网站上给出的地址一查是 在 Castro Valley。再用 GOOGLE 地图一看,这不就是他家嘛!YOUTUBE 视频里小伙子就是在一个车库里瓶瓶罐罐倒来倒去,五颜六色的仪器一闪一闪,如同电影里的 mad 科学家,原来就在这!想当年苹果公司、惠普公司、谷歌公司就是在自家车库倒腾。知识时代,knowledge rich 比 asset rich 强。谁小看车库实验室就是势利眼加无知。

CRISPR基因编辑技术我这里就不讲了。前几天我在《CRISPR 基因编辑技术及张锋的贡献》及《CRISPR技术的显然性分析 》介绍了。读者如果有兴趣的,应该把这两篇博文看看。因为我不是生物专业,缺乏背景知识,到处都是问号,我是读了一系列论文、看了一系列视频讲座之后,才算是把理论搞清楚了。所以我的介绍是从头开始,即使用术语也会解释。大家看完我两篇博文之后,应该知道 CRISPR,Cas9、crRNA、tracrRNA 等术语及其准确含义,对类似的技术应该也能够触类旁通。从2013年开始,这个技术的发展如雨后春笋,其效率也越来越高。但120美金能在自家厨房做实验,比游戏机还便宜好多,三年前的尖端生物技术走入平常百姓家,西方科技文明的进化速度令人惊叹。

到ODIN网站一看,现在这个 DIY 工具盒涨价了,140美金,链接是 http://www.the-odin.com/diy-bacterial-gene-engineering-crispr-kit/ 。除了各种试管、试剂之外,关键的东西有几个:Cas9+tracrRNA 的质粒,crRNA 质粒,DNA模板,以及 E. coli HME63  菌。看了我的CRISPR介绍文章应该知道,这是对原核细胞进行基因编辑,还是比较简单的。这个实验没有把 tracrRNA 与 crRNA 结合成 chimera ,所以接近自然的 CRISPR-Cas9 系统 --- chimera RNA 可能触及了UC 道得娜博士的专利。实验目的是改造这个细菌的性能使它能在本来不能生存的环境生存。具体来说其机制是,用 CRISPR-Cas9 在细菌DNA由 crRNA 确定的目标点形成双断链,英文术语叫 double stranded break,在细菌DNA修复过程中由于模板DNA的存在,部分会发生替换,把细菌基因的一个字母改变,细菌就不同了。具体的细节有兴趣的可以自己看。我开始还不明白怎么把这些质粒打进细菌里面。后来看了他的 protocol 解释才知道是通过加一些试剂后,细菌会把质粒吸收进去,然后质粒借用细菌体内的环境进行表达,生成出 Cas9 全套系统,相当于细菌自己产生 Cas9 把基因给转了。

有人可能说,这个实验只是在固定点进行转基因,如果我要自己定点怎么办?我查了下,网上还有别的公司,你可以在网上输入你要的目标核苷酸序列,下单订购后,这公司给你送来对应的 crRNA + tracrRNA。当然,真核细胞编辑要复杂些,还要加上 NLS 之类,也不知张锋的专利是不是适用。

ODIN网站上还有其他的产品,如给酵母菌转基因的工具盒。最贵的产品是645美金的一套基因工程家用实验室,http://www.the-odin.com/genetic-engineering-home-lab-kit/, 包括PCR基因放大器、电泳装置、各种试剂、试管、容器等等。PCR 是很有用的技术,有兴趣的在网上可以看视频介绍。我用放大镜看了ODIN网站上的产品图像,发现其 PCR 机器是 PERKIN ELMER GeneAmp PCR SYSTEM 2400。旧的在EBAY上只要 100 美金就能买到,不知淘宝上有没有。ODIN的网站上说美国有很多过剩的物资,他们就是买来进行测试之后,配套出售。

ODIN产品的利润率可能不低,但更主要的是有市场。美国民众平均教育程度高,科学爱好者很多。看网上的评论,很多人表现了非常大的兴趣。有个电视台的记者自己买来试了,创造出了新菌种。还有一个年轻人在失败一次之后也成功了,写博文称感觉当了回上帝。YOUTUBE上 有个爸爸带着四岁的儿子就在家里的地毯上打开邮包,开始基因编辑了,就像跟买了个照相机测试一下一样。不过,这个实验需要约一个星期时间(主要是等待细菌生长),不像照相机那么立竿见影。


随着知识共享程度的大大扩张,西方科技文明的发展在过去20多年进入了一个人类历史上从未有过的阶段,其发展是超加速性的。科学技术民主化的概念很深刻。我没有学过分子生物,但在网上可以直接看 Charpentier/Doudna/Zhang 的讲座。张锋大概10岁左右来到美国,在美国上中学就开始进行分子生物实验,如今才30出头。在知识共享、技术共享方面中国远远落后,这也阻碍了科技的创新发展。这是一个隐忧。那些唱衰小看西方文明的山西煤老板类型得有清醒认识。西方可能处于一个智力的 inflationary 爆炸阶段。




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