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schrodinger中N原子的手性

已有 7169 次阅读 2014-11-18 14:14 |个人分类:大数据|系统分类:科研笔记

###########网络中的材料##################

sp3的N不算那个孤对电子是三角锥结构的,但三个基团在室温下就很容易"伞转",一般也不认为是手性

sp2的N是平面的,没有手性

三级胺中因为N上有一个孤对电子,所以可以认为N连接的四个基团不同,所以具有手性,但是因为孤对电子的位阻较小,所以N上连接的另外三个基团可以转动,一般不考虑其手性。并且很难拆分

讨论手性,要注意是4个不同的基团,3个基团只能确定一个平面,而不能确定一个空间立体构型
所以氮原子一般不考虑手性,如果涉及氮原子考虑手性,那么肯定是因为出现了空间因素,比如看不到手性碳原子,但是由于空间构型导致出现一个对映体。

氮原子的三个取代基如果不相同,确实是具有手性的。但是在常温下,氮原子的孤对电子存在速率非常快的翻转(氮翻转),所以不讨论其手性问题。但是在很低的温度,或者比较刚性的骨架中使得氮原子的翻转速率很低或者没有翻转时,这个立体中心才是手性的。

氮原子3取代的时候很容易翻转的,除非是季铵盐才比较容易保持住手性。

有没有手性就看氮原子能不能被锁住,比如在刚性环上,这样子不能快速翻转就可能有手性了

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##################在maestro中的测试结果############################

3级胺是不考虑手性的。

只考虑季胺的手性



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