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加力动力学采样后获得的轨迹,在pymol中可能会出现不连续的情况;
将其在schrodinger中打开,然后到 pymol 就可以显示正常。
ASP0-19是后来增加的loop;
断开之处的距离是在共价半径之类,但是并没有自动连接在一起;Pymol中的显示不仅仅是由坐标决定的。
氨基酸编号,重新显示。
从中我们看出pymol的逻辑,认为165和166之间应该是连接的;19和20也是连接的;
真实情况是165连接0-19 再连接166;
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