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Plant Biotechnology Journal - 2018年中国作者热点论文精选

已有 1205 次阅读 2019-4-12 14:27 |个人分类:热点研究|系统分类:论文交流




论文介绍

 Highefficient multisites genome editing in allotetraploid cotton (Gossypiumhirsutum ) using CRISPR/Cas9 system

  • Pengcheng Wang/ Jun Zhang/ Lin Sun/ Yizan Ma/ Jiao Xu/ Sijia Liang/ Jinwu Deng/ Jiafu Tan/ Qinghua Zhang/ Lili Tu/ Henry Daniell/Shuangxia Jin*/ Xianlong Zhang*

  • 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北武汉jsx@mail.hzau.edu.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12755

  • Highlight:本研究证明CRISPR / Cas9系统对于异源四倍体棉花基因组编辑是高效和可靠的。


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12755


 CRISPR/Cas9‐mediated targeted mutagenesis of GmFT2a delays flowering time in soya bean

  • Yupeng Cai/ Li Chen/ Xiujie Liu/ Chen Guo/ Shi Sun/ Cunxiang Wu/Bingjun Jiang/ Tianfu Han/ Wensheng Hou*

  • 中国农业科学院作物科学研究所国家植物转基因研究中心,中国农业科学院作物科学研究所,农业部大豆生物学重点实验室 houwensheng@caas.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12758

  • Highlight:

  • 在这项研究中,采用CRISPR / Cas9系统特异性诱导GmFT2a的定向诱变。通过根癌农杆菌介导的转化,用三种靶向内源GmFT2a的不同位点的sgRNA / Cas9载体转化大豆栽培品种。发现定向诱变是稳定遗传的,并且纯合的GmFT2a突变体在长日和短日条件下都表现出晚开花。

  • 这些GmFT2a的“转基因清洁”突变体可为更深入研究GmFT2a功能和大豆中光周期反应的分子机制提供材料。他们还将为大豆育种和区域引进做出贡献。

CRISPR/Cas9-induced ft2a mutants exhibited late flowering in the T2 generation under both long-day (LD) and short-day (SD) conditions.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12758



CRISPR/Cas9‐mediated efficient targeted mutagenesis in grape in the first generation

  • Xianhang Wang/ Mingxing Tu/ Dejun Wang/ Jianwei Liu/ Yajuan Li/Zhi Li/ Yuejin Wang/ Xiping Wang

  • 西北农林科技大学园艺学院干旱区作物胁迫生物学国家重点实验室, 西北农林科技大学农业部西北地区园艺植物生物学与种质创新重点实验室wangxiping@nwsuaf.edu.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12832

  • Highlight: 本研究得出结论,CRISPR / Cas9系统允许在第一代葡萄中进行精确的基因组编辑,并且代表了基因功能分析和葡萄分子育种的有用工具。


Induction of proembryonal masses (PEM) and grape transformation


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12832


Multiplexed CRISPR/Cas9‐mediated metabolic engineering of γ‐aminobutyric acid levels in Solanum lycopersicum

  • Rui Li/ Ran Li/ Xindi Li/ Daqi Fu/ Benzhong Zhu/ Huiqin Tian/Yunbo Luo*/ Hongliang Zhu*

  • 中国农业大学食品科学与营养工程学院lyb@cau.edu.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12781

  • Highlight:本文数据表明,多重CRISPR / Cas9系统可用于精确编辑番茄基因组序列并有效地创建多位点敲除突变,这可以为植物代谢工程法规提供新的信息。


pYLCRISPR/Cas9 system-mediated genome editing in tomatoes.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12781


Global profiling of alternative splicing landscape responsive to drought, heat and their combination in wheat (Triticum aestivum L.)

  • Zhenshan Liu/ Jinxia Qin/ Xuejun Tian/ Shengbao Xu/ Yu Wang/Hongxia Li/ Xiaoming Wang/ Huiru Peng/ Yingyin Yao/ Zhaorong Hu/ Zhongfu Ni/ Mingming Xin*/ Qixin Sun*

  • 农业生物技术国家重点实验室,作物杂种优势利用重点实验室,中国农业大学作物遗传改良北京市重点实验室mingmingxin@cau.edu.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12822

  • Highlight: 这项研究对小麦幼苗的干旱胁迫(DS),热胁迫(HS)及其组合(HD)的AS响应进行了全基因组分析,并进一步将其与转录反应进行了比较。后提出转录调控可能在响应DS时起主要作用,DS与AS调节协调以促进小麦的HS和HD耐受。


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12822


Increasing the efficiency of CRISPR‐Cas9‐VQR precise genome editing in rice

  • Xixun Hu/ Xiangbing Meng/ Qing Liu/ Jiayang Li*/ Kejian Wang*

  • 中国科学院大学, 中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室和国家植物基因研究中心jyli@genetics.ac.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12771

  • Highlight: 在本研究中,通过修饰单指导RNA(sgRNA)结构和强内源启动子,显着提高了VQR变体的编辑效率。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12771 


Establishing RNA virus resistance in plants by harnessing CRISPR immune system

  • Tong Zhang/ Qiufeng Zheng/ Xin Yi/ Hong An/ Yaling Zhao/ Siqi Ma/ Guohui Zhou*

  • 华南农业大学农业学院广东省微生物信号与疾病控制重点实验室ghzhou@scau.edu.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12881

  • Highlight:本文数据表明CRISPR / Cas9系统可用于产生对RNA病毒稳定抗性的植物,从而扩大了这种技术在农业领域中用于病毒控制的用途。

Transient expression of the Francisella novicida CRISPR-Cas9 system in Nicotiana benthamiana conferred resistance to CMV.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12881


High‐efficiency genome editing using a dmc1 promoter‐controlled CRISPR/Cas9 system in maize

  • Chao Feng/ Handong Su/ Han Bai/ Rui Wang/ Yalin Liu/ Xianrui Guo/ Chang Liu/ Jing Zhang/ Jing Yuan/ James A. Birchler/ Fangpu Han*

  • 中国科学院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室fphan@genetics.ac.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12920

  • Highlight:

  • 本文报告了使用玉米dmc1基因启动子与Cas3和sgRNA的U3启动子组合的靶向基因组编辑的结果。

  • 研究结果表明,dmc1启动子控制(DPC)CRISPR / Cas9系统在玉米中高效性,并提供进一步的证据,用于CRISPR / Cas9系统的启动子的优化对于提高植物中靶向基因组编辑的效率是重要的dmc1基因的进化保守性表明其可用于其他植物物种。

Phenotypes of the T1 seedlings by targeting the zb7 gene using DPC CRISPR/Cas9 system.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12920


Genotyping genome‐edited mutations in plants using CRISPR ribonucleoprotein complexes

  • Zhen Liang/ Kunling Chen/ Yan Yan/ Yi Zhang/ Caixia Gao*

  • 中国科学院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室,基因组编辑中心cxgao@genetics.ac.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12938

  • Highlight:

  • 本文应用纯化的CRISPR核糖核蛋白复合物切割PCR产物,用于在六倍体小麦和二倍体水稻中进行基因组编辑的突变检测。

  • 证明这种突变检测方法比Sanger测序更敏感,比PCR / RE方法更适用,不需要限制酶位点。

  • 证明了这种检测方法对于小麦中的基因组编辑特别有用,因为靶位点通常被单核苷酸多态性包围。使用这种筛选方法,我们还能够检测由纯化的TALEN蛋白诱导的外源无DNA标签w2突变。

  • 最后显示也可以使用高保真SpCas9变体或FnCpf1检测部分碱基编辑突变。 

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12938


Comparative transcriptome combined with morpho‐physiological analyses revealed key factors for differential cadmium accumulation in two contrasting sweet sorghum genotypes

  • Juanjuan Feng/ Weitao Jia/ Sulian Lv/ Hexigeduleng Bao/ Fangfang Miao/ Xuan Zhang/ Jinhui Wang/ Jihong Li/ Dongsheng Li/ Cheng Zhu/ Shizhong Li/ Yinxin Li*

  • 中国科学院植物研究所植物分子生理学重点实验室 yxli@ibcas.ac.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12795

  • Highlight:在这项研究中,研究了两个对比甜高粱基因型(高Cd积累一个H18和低Cd积累一个L69)之间差异Cd积累的关键因素。提出了H18和L69中差异性Cd吸收和转运的主要过程的示意图,这表明H18中较高的Cd积累依赖于有效Cd吸收和转运的多级协调,包括有效的根吸收和木质部负荷,较少的根细胞壁结合,和较弱的内胚层质外障碍。

A schematic representation of main processes involved in differential Cd uptake and translocation in H18 and L69 plants.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12795


The pomegranate (Punica granatum L.) genome provides insights into fruit quality and ovule developmental biology

  • Zhaohe Yuan*/ Yanming Fang*/ Taikui Zhang/ Zhangjun Fei/Fengming Han/ Cuiyu Liu/ Min Liu/ Wei Xiao/ Wenjing Zhang/Shan Wu/ Mengwei Zhang/ Youhui Ju/ Huili Xu/ He Dai/ Yujun Liu/Yanhui Chen/ Lili Wang/ Jianqing Zhou/ Dian Guan/ Ming Yan/Yanhua Xia/ Xianbin Huang/ Dongyuan Liu/ Hongmin Wei/Hongkun Zheng*

  • 南京林业大学南方可持续林业联合创新中心zhyuan88@hotmail.com

  • DOI: 10.1111/pbi.12875

  • Highlight:

  • 本文报告了274-Mb高质量的草本石榴基因组序列,其覆盖估计的336-Mb基因组的约81.5%,由2177个支架组成,N50大小为1.7Mb,含有30903个基因。该基因组序列为扩展我们对一些独特生物过程的理解以及促进比较生物学研究和作物育种提供了重要资源。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12875


Single‐base methylome analysis reveals dynamic epigenomic differences associated with water deficit in apple

  • Jidi Xu/ Shasha Zhou/Xiaoqing Gong/ Yi Song/ Steve van Nocker/Fengwang Ma*/ Qingmei Guan*

  • 西北农林科技大学园艺学院干旱区作物胁迫生物学国家重点实验室fwm64@nwsuaf.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12820

  • Highlight:

  • 这项研究在商业苹果(Malus x domestica)的基因组中以单碱基分辨率绘制了胞嘧啶甲基化,并分析了代表性干旱敏感和耐旱品种中与水分亏缺相关的甲基化模式的变化。相应结果呈现了苹果基因组的甲基化组图,并揭示了响应水分亏缺胁迫的广泛的DNA甲基化改变。这些数据将有助于理解在自然环境中生长并受到非生物和生物胁迫攻击的植物中DNA甲基化和基因表达之间的潜在联系。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12820


Optimized paired‐sgRNA/Cas9 cloning and expression cassette triggers high‐efficiency multiplex genome editing in kiwifruit

  • Zupeng Wang/ Shuaibin Wang/ Dawei Li/ Qiong Zhang/ Li Li/Caihong Zhong/ Yifei Liu*/ Hongwen Huang*

  • 中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室, 广东省应用植物学重点实验室liuyifei@scbg.ac.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12884

  • Highlight:在这项研究中,开发了一种新的克隆策略,用于生成含有四种靶向猕猴桃八氢番茄红素去饱和酶基因(AcPDS)的sgRNA的配对-sgRNA / Cas9载体。最后得出结论,PTG / Cas9系统是比传统的CRISPR / Cas9系统用于猕猴桃基因组编辑相比较更加的优异,这为优化其他植物中的CRISPR / Cas9编辑系统提供了有价值的线索。

Albino phenotypes induced by site-specific editing in kiwifruit.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12884


 A maize phytochrome‐interacting factors protein ZmPIF1 enhances drought tolerance by inducing stomatal closure and improves grain yield in Oryza sativa

  • Yong Gao/ Meiqin Wu/ Mengjiao Zhang/ Wei Jiang/ Xiaoyun Ren/Enxing Liang/ Dongping Zhang/ Changquan Zhang/ Ning Xiao/Yan Li/ Yi Dai/ Jianmin Chen*

  • 扬州大学江苏省作物遗传生理学与植物功能基因组学重点实验室jmchen@yzu.edu.cn

  • DOI: 10.1111/pbi.12878

  • Highlight:本文克隆并表征了玉米(Zea mays)PIF转录因子ZmPIF1。总体而言,ZmPIF1在ABA介导的气孔关闭调节中起重要作用,以控制水分流失。 ZmPIF1可以提高水分的节水和抗旱性,提高水稻的作物产量,说明ZmPIF1对作物改良的能力。


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12878


Construction of a multicontrol sterility system for a maize male‐sterile line and hybrid seed production based on the ZmMs7 gene encoding a PHD‐finger transcription factor

  • Danfeng Zhang/ Suowei Wu/ Xueli An/ Ke Xie/ Zhenying Dong/Yan Zhou/ Liwen Xu/ Wen Fang/ Shensi Liu/ Shuangshuang Liu/Taotao Zhu/ Jinping Li/ Liqun Rao/ Jiuran Zhao/ Xiangyuan Wan

  • 北京市农林科学院玉米研究中心玉米DNA指纹图谱与分子育种北京市重点实验室wanxiangyuan@ustb.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12786

  • Highlight: 本文通过转基因策略开发基于玉米雄性不育7(ms7)突变体及其野生型玉米雄性不育7(ZmMs7)基因的多控制不育(MCS)系统,诱导GMS在杂种种子中的利用生产指出MCS系统具有提高玉米雄性不育系繁殖和商业杂交种子生产效率的巨大潜力。

Phenotypic comparison of the wild type (WT) and ms7-6007 mutant.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12786


The genetic architecture of amylose biosynthesis in maize kernel

  • Changsheng Li/ Yongcai Huang/ Ruidong Huang/ Yongrui Wu/Wenqin Wang*

  • 上海交通大学农业与生物学院 wang2015@sjtu.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12821

  • Highlight: 本研究发现可以转移连接的候选基因以操纵直链淀粉含量,从而在育种计划中增加玉米籽粒的价值。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12821


Enhancing auxin accumulation in maize root tips improves root growth and dwarfs plant height

  • Zhaoxia Li/ Xinrui Zhang/ Yajie Zhao/ Yujie Li/ Guangfeng Zhang/Zhenghua Peng/ Juren Zhang*

  • 山东大学生命科学学院jrzhang@sdu.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12751

  • Highlight:在这项研究中,ZmPIN1a在玉米中的过量表达增加了侧根的数量并抑制了它们的伸长,形成了一个发育的根系,具有更长的精根和更密集的侧根。根中生长素的增加使植物能够向根部分配更多的碳水化合物,增强根的生长并改善植物对环境胁迫的抗性。这些研究结果表明,通过根系育种可以改善玉米植物结构,从而为进一步提高产量创造理想的表型。

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12751


Precise editing of CLAVATA genes in Brassica napus L. regulates multilocular silique development

  • Yang Yang/ Kaiyu Zhu/ Huailin Li/ Shaoqing Han/ Qingwei Meng/Shahid Ullah KhanChuchuan Fan*/ Kabin Xie/ Yongming Zhou

  • 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 fanchuchuan@mail.hzau.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12872

  • Highlight:本研究提出了使用CRISPR / Cas9系统在CLV信号通路中有效敲除CLAVATA3(CLV3)的油菜籽同源物的分子肽及其相关受体CLV1和CLV2的证据,并实现了三代突变的稳定传递。同时还评估了通过授粉水平转移Cas9 / gRNA盒的效率。我们的研究结果揭示了植物育种策略在当前栽培油菜品种中提高产量性状的潜力。

Phenotypes of the BnCLV3 mutants.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12872


The C2H2 zinc‐finger protein SlZF3 regulates AsA synthesis and salt tolerance by interacting with CSN5B

  • Ying Li/ Zhuannan Chu/ Jinying Luo/ Yuhong Zhou/ Yujing Cai/Yongen Lu/ Junhui Xia/ Hanhui Kuang/ Zhibiao Ye/ Bo Ouyang*

  • 华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室,园艺作物生物学与遗传改良重点实验室bouy@mail.hzau.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12863

  • Highlight: 本文报道了一种来自番茄(Solanum lycopersicum)的新型调控基因,命名为SlZF3,其编码具有EAR抑制结构域的Cys2 / His2型锌指蛋白。研究结果表明,SlZF3同时促进AsA的积累并增强植物盐胁迫耐受性。

Spatial and salt-inducible expression of SlZF3.


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12863


Long noncoding RNAs involve in resistance to Verticillium dahliae, a fungal disease in cotton

  • Lin Zhang/ Maojun Wang/ Nannan Li/ Honglei Wang/ Ping Qiu/Liuling Pei/ Zheng Xu/ Tianyi Wang/ Erlin Gao/ Junxia Liu/ Shiming Liu/ Qin Hu/ Yuhuan Miao/ Keith Lindsey/ Lili Tu/ Longfu Zhu/Xianlong Zhang*

  • 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室xlzhang@mail.hzau.edu.cn

  • DOI:10.1111/pbi.12861

  • Highlight:这项研究描述了一种全面的疾病反应lncRNA谱,以防御棉花真菌病黄萎病菌。该研究代表了涉及真菌疾病抗性的lncRNA的首次表征,并为阐明棉花疾病反应机制提供了新的线索。

Identification and characterization of long noncoding RNAs (lncRNAs) in Gossypium barbadense and Gossypium hirsutum


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12861


Recent insights into cotton functional genomics: progress and future perspectives

  • Javaria Ashraf/ Dongyun Zuo/ Qiaolian Wang/ Waqas Malik/Youping Zhang/Muhammad Ali Abid/ Hailiang Cheng/ Qiuhong Yang/ Guoli Song*

  • 中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室sglzms@163.com

  • DOI:10.1111/pbi.12856

  • Highlight:本文全面概述了最近的工具和资源,以及棉花功能基因组学在开发精英棉花基因型方面取得的重大进展。作者认为,下一阶段的棉花功能基因组学需要对基因组草案进行细化,重新测序广泛的多样性小组,开发高通量功能基因组学工具,并在即将到来的棉花改良计划中整合多学科方法。

A scheme of the sequential research processes from whole-genome sequencing to practical functional genomics in cotton


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12856


Improvement of drought tolerance by overexpressing MdATG18a is mediated by modified antioxidant system and activated autophagy in transgenic apple


  • Xun Sun/ Ping Wang/ Xin Jia/ Liuqing Huo/ Runmin Che/Fengwang Ma*

  • 西北农林科技大学园艺学院干旱区作物胁迫生物学国家重点实验室fwm64@sina.com

  • DOI:10.1111/pbi.12794

  • Highlight:本文发现MdATG18a在番茄植物中的异源表达显着增强了它们对干旱的耐受性。这些过程有助于降低蛋白质聚集并限制氧化损伤,从而表明自噬在干旱反应中起重要作用。


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.12794





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Impact factor:6.305

ISI Journal Citation Reports @ Ranking: 2017:12/160 (Biotechnology & Applied Microbiology)

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Plant Biotechnology Journal is published by Wiley-Blackwell in association with the Society for Experimental Biology (SEB) and the Association of Applied Biology (AAB).Plant Biotechnology Journal aims to publish high-impact original research and incisive reviews by leading researchers in applied plant science, with an emphasis on molecular plant sciences and their applications through plant biotechnology. We aim to provide a forum for the most important advances in this field, including curiosity-driven studies with the potential for application, strategic research in plant biotechnology, scientific analysis of key issues for the beneficial application of plant sciences and scientific analysis of the performance of the products of plant biotechnology in practice.


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