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Bicomb软件处理pubmed的xml格式中出现问题的临时解决办法

已有 4821 次阅读 2018-4-2 10:44 |个人分类:生物医学文本挖掘|系统分类:科研笔记

 最近发现,提取pubmed2016年以后的记录过程中出错,如下图:


blob.png


经过反复调查,发现是因为下载的文献中,标题内容中存在<sup>或<sub>或<i>字符,导致提取意外终止。包括:

<b>    (bold)

<i>    (italic)

<sup>  (superscript)

<sub>  (subscript) 

<u>    (underline) 

临时替代的解决办法是先用记事本打开,把这些“非法字符”替换掉。


另外,在提取步骤中出现停滞的状态时,可以按“Alt+F4”组合键关闭前置窗口,不必强行关闭程序。



http://blog.sciencenet.cn/blog-82196-1106934.html

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1 刘继为

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