1927年春，国民政府定都南京。5月，决定设立中央研究院筹备处。

1927年7月，国民政府公布《中华民国大学院组织条例》，规定“本院设立中央研究院”。具体设立理化实业研究所、社会科学研究所、地质研究所、观象台四个研究机构。

1928年4月，国民政府公布《修正国立中央研究院组织条例》，改中华民国大学院中央研究院为国立中央研究院，蔡元培为院长。

1928年11月9日，国民政府公布了《国立中央研究院组织法》，第一条规定“国立中央研究院直隶于国民政府，为中华民国最高学术研究机关”；第二条规定国立中央研究院的任务是：一、实行科学研究；二、指导、联络、奖励学术之研究。第六条规定设如下研究所：物理研究所、化学研究所、工程研究所、地质研究所、天文研究所、气象研究所、历史语言研究所、国文学研究所、考古学研究所、心理学研究所、教育研究所、社会科学研究所、动物研究所、植物研究所。

1928年国立中央研究院成立后，观象台分为天文研究所、气象研究所，均设于南京；社会科学研究所分法制、民族、经济、社会四组，前二组设于南京，后二组设于上海；分理化实业研究所为物理研究所、化学研究所、工程研究所，均设于上海；地质研究所设于上海，设历史语言研究所于广州，旋迁北平。1929年5月，心理研究所设于北平。

1929年1月，蔡元培院长聘李四光、秉志、钱崇澍、颜复礼、李济、过探先及钱天鹤七人，为博物馆筹备处筹备委员会委员，以钱天鹤为常务委员，筹备处设立于南京成贤街46号。当月30日，筹备委员会开会，决定博物馆定名为国立中央研究院自然历史博物馆。由于筹备委员中有出国者，有病故者，当年7月，由院长改聘李四光、秉志、钱崇澍、李济、王家楫及钱天鹤六人为筹备委员，仍以钱天鹤为常务委员。筹备过程中，通过职员名单、筹拟计划，装置标本，修建房屋，布置园场等项工作相继完成。至1930年1月筹备大致就绪，于是取消筹备处，由院长聘钱天鹤为主任，李四光、秉志、钱崇澍、李济、王家楫为顾问，国立中央研究院自然历史博物馆正式成立。

全馆由研究、事务、顾问三部分组成，研究部分设动物组、植物组，每组由技师一人总其成。动物组技师方炳文，植物组技师秦仁昌。1932年8月，伍献文从法国归来，与方炳文共同担任动物组技师。

为符合《国立中央研究院组织法》，自然历史博物馆于1934年7月1日改名为中央研究院动植物研究所，王家楫任所长。抗日战争爆发后，先后迁至湖南南岳、广西阳朔、四川北碚。1944年5月分立为动物研究所、植物研究所，王家楫任动物研究所所长。抗战胜利后，动物所由北碚迁至上海。新中国成立后，中国科学院将前中央研究院动物研究所的主体、部分植物所的研究人员及北平研究院、山东大学的部分研究人员合并，于1950年组成中国科学院水生生物研究所，王家楫任所长，所址设在上海，1954年迁至武汉。　　　

参考文献：《国立中央研究院总报告》

（张晓良，2000年8月，2008年9月补充）