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如何判断bam文件是单端还是双端？

已有 1766 次阅读 2023-2-7 21:05 |系统分类:科研笔记

1，进入R，安装Rsamtools

BiocManager::install(“Rsamtools”)

2，载入Rsamtools包

library(Rsamtools)

3，读取bam文件

testPairedEndBam("test.bam")

4，返回结果

若返回TRUE，则test.bam为双端；返回FALSE，则test.bam为单端

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