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[转载]Protein-Sol -- 一个从序列预测蛋白质可溶性的网络工具

已有 6721 次阅读 2019-3-20 07:10 |个人分类:网站|系统分类:科研笔记| 蛋白质, 可溶性 |文章来源:转载

蛋白质可溶性是工业和治疗应用中一种重要的性质。尽管有对相关物化性质越来越多的理解,但是预测仍是一项挑战。

Protein-Sol从序列预测蛋白质可溶性。使用无细胞表达系统中可用的大肠杆菌蛋白质可溶性数据,计算了35种基于序列的性质。从分开低可溶性子集和高可溶性子集中确定特征权重。

输入序列:
protein_sol.png

输出:
protein_sol_out.png

模型返回一个预测的可溶性,和一个最大偏离平均值的特征指示。沿着序列在窗口计算中描述了两种其他性质:折叠倾向,和该段的静电荷。


返回值大于0.45即认为可溶


下载:http://protein-sol.manchester.ac.uk
时间:20170529
参考:Protein-Sol: A web tool for predicting protein solubility from sequence




https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1168464.html

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