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[转载]【Ziv Bar-Joseph教授课件】计算生物学:序列比对与剖面HMMs

已有 1658 次阅读 2019-1-29 09:18 |系统分类:科研笔记| 【Ziv |文章来源:转载

本课件主要内容包括:

1. 中心法则

2. 日益增长的生物数据

3. FDA批准基于基因的乳腺癌试验

4. 用于数据集成的输入输出HMM

5. 主动学习

6. 序列同源函数

7. 序列分析技术

8. 序列比对:导致差异的可能原因

9. 双序列比对

10. Scoring Alignments

11. 计算最优比对:Needham-Wuncsh算法

12. 示例

13. 关于计算时间

14. 蛋白质家族

15. 描述蛋白质家族的方法

16. 多比对过程

17. 从已有的比对中训练HMM

18. 记住一个简单的例子

19. 选择最优的模型:将序列比对用于模型

20. 简单HMM的打分

21. 未比对序列的训练

22. 设计HMMs:共识(匹配)状态

23. 设计HMMs:插入

24. 设计HMMs:删除

25. 总结





完整课件下载地址:

http://page2.dfpan.com/fs/clc5j242132951653b4/  


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