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Plant Cell│根特大学研究者发文综述CRISPR筛选技术在植物中的应用

已有 537 次阅读 2021-4-6 20:31 |系统分类:论文交流

2021年4月5日,根特大学Thomas B Jacobs研究团队在The Plant Cell 发表了题为CRISPR Screens in Plants: Approaches, Guidelines, and Future Prospects的综述文章,文章对CRISPR筛选技术在植物中的应用进行了综述:植物CRISPR筛选技术的发展为更高分辨率和更大规模地分析植物基因组提供了新的机会,并将极大地促进功能生物学和合成生物学的研究。



CRISPR-Cas 系统通过促进广泛的靶向DNA 扰动,实现了基因组工程的革命性变革。这些系统能够开发功能强大的新型筛选技术,从而在基因组规模上测试基因功能。尽管使用CRISPR 筛选技术正在以前所未有的速度和规模来绘制和研究基因调控网络,且具有巨大潜力,但它们在植物中的应用仍处于起步阶段。


本综述讨论了在植物中建立CRISPR 筛选的一般概念,工具和工作流程,并分析了一些最近的报告,这些报告描述了使用该策略产生敲除突变体集合或使DNA 序列多样化的方法。此外,鉴于当前的挑战和局限性,本文提供了有关如何在植物中设计CRISPR 基因敲除筛选的见解,并探讨了多种设计方案。最后,本文讨论了CRISPR 筛选的独特多重功能,以研究高度重复的植物基因组中的冗余基因功能。组合突变体筛选具有产生更高阶突变体集合并促进基因网络表征的潜力。通过将这种方法与过去二十年来产生的众多基因组图谱进行整合,CRISPR 筛选的实施为以更深的分辨率分析植物基因组提供了新的机会,并将导致功能和合成生物学的巨大进步。组合突变体筛选具有常规产生更高阶突变体集合并促进基因网络表征的潜力。


Mapping and characterization of plant gene regulatory networks using CRISPR screens


综上,通过将该方法与过去二十年中产生的大量基因组图谱相结合,CRISPR 筛选技术的实现为更深层次的解析植物基因组提供了新的机遇,并将推动功能和合成生物学的发展。


文章链接:https://academic.oup.com/plcell/advance-article/doi/10.1093/plcell/koab099/6211199




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