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ABO血型与SNP

已有 4841 次阅读 2019-5-6 16:32 |个人分类:biology|系统分类:科研笔记

根据SNPedia(一个snp维基百科式的网站),以及果壳网上的一篇文章,来看一下我的血型,顺便还可以分辨你的血型抗原基因型,比如A和B型血,到底是AA(BB)还是AI(BI)。下面我就来看一下我的,当然准确率有限,因为:

其实通过SNP(Single Nucleotide Polymorphism,单核苷酸多态)位点检验ABO血型的方法早有研究,但是人群中的大规模验证比较少;另一方面,三位点(rs8176746,rs8176747,rs8176719)的检验方法已经发现有3%左右的错误率。

根据这篇文章《法医SNP复合检测体系的构建及应用》的这四个位点,应该是比较适合中国人的,我可以判断我的血型是AB型的。

我的四个位点的基因型分别是:

rs8176719(–)两个缺失,提示O型;
rs8176720(AG),提示AB型;
rs1053878(GC),不能说明问题,好像我的基因型还和这个不太一样,可能是芯片错误。

rs8176747,这信位点没有信息。。。

其他的相关位点还有:

rs8176746 
Geno Mag Summary

  • (A;A) Type B blood group (of ABO system) #也就是纯B型血

  • (A;C) Type B blood group (of ABO system); one allele #杂合B型血 <—我是这个基因型的

  • (C;C) 0 #非B型血

rs7853989

  • (C;C) Likely blood group B

  • (C;G) Likely blood group B <—我是这个基因型的

  • (G;G) Not blood group B

那么结合这两个信息,我应该可以判断我的血型是AB吧,虽然不怎么严谨,不得不说用几个snp判断血型还是稍微有点困难。。。
这还有个rs590787,是关于Rh阳性阴性的,我的数据没有这个位点。

  • (C;C) 1 Rh- (Rhesus negative)

  • (C;T) 1 Rh+ (Rhesus factor positive)

  • (T;T) 1 Rh+ (Rhesus factor positive)

参考:
1.https://www.docin.com/p-1507745323.html




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