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aspera在mac和win下的使用命令整理

已有 4985 次阅读 2019-4-8 14:22 |个人分类:biology|系统分类:科研笔记

这两天在用mac下载ena的fastq数据,发现aspera connect,windows和mac版本的死活不会用呢,于是就学习了一下,发现一样是可以使用命令行的,这里是mac的,后面再整理下win的。

Mac的命令,找的比较辛苦

/Users/zd200572/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources
cp asperaweb_id_dsa.openssh ~
ascp -QT -l 300m -P33001 -L- -k1 -i asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:vol1/fastq/ERR101/005/ERR1018205/ERR1018205_1.fastq.gz /Volumes/MacOS/BioData/metagenomics

这样,就可以享受榨干带宽的乐趣了,不得不说这个技术的强大。–k1参数还可以实现断点续传。

有了mac的经验,win的相对轻松了

安装好程序后,源文件在:E:\Users\shenyou\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp.exe

密钥文件在E:\Users\shenyou\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\etc\asperaweb_id_dsa.openssh

所以,命令就稍微修改一下就可以了。

ascp.exe -QT -l 300m -P33001 -L- -k1 -i  ..\asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:vol1/fastq/ERR101/005/ERR1018205/ERR1018205_1.fastq.gz  .#最后这个点是目标目录,.代表当前目录




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