几个月前，国际上发表了人类基因组中大量非编码序列的生化活性，作者因此号称是发现了基因组中大部分序列都有生化功能。很多媒体，包括Nature、Science等都将此视彻底抛弃垃圾DNA概念的依据。

真得可以由此下结论人类基因组没有垃圾DNA吗？在前面的博客中，我对此表示出强烈怀疑“我越想越不对头。这个研究的结果没问题，但是结论下得过于草率，甚至可能是错误的。按照PLoS ONE审稿的标准“Conclusions are presented in an appropriate fashion and are supported by the data”，他们Nature那篇主文章是不合格的”。

应该说，这一研究（称为ENCODE项目）规模庞大，研究结果产生了海量的有价值分子生物学数据，可以视作2012年生物医学领域的头等大事，在9月28日的博文中，我曾预言它将荣登各大2012年各大研究成果排行榜。今天，看到了第一个排行榜，《时代》杂志评出2012年十大医学突破，此项目占据头把交椅（1）。等着看吧，年末公布的其他排行榜，也少不了这个ENCODE。

别的大项目，学习它的结论就好了。但ENCODE既影响巨大、但又存在巨大争议。这就很值得大家关注、并尽可能参与其中。ENCODE的巨大影响会带来对人类基因组的巨大误解。作为相关领域的科研人员，大家有必要参与讨论、澄清事实。即便是发表评论性文章没有原创成果、对自己的学术地位没有任何帮助，也应该积极参与。如果听之任之，建立在NECODE错误结论上的对人类基因组的巨大误解，会影响大家今后相关研究论文的投稿、甚至相关研究项目基金的申请。被他们误导的审稿人、评审人会认为你的想法不靠谱，你不懂最新的人类基因组研究进展。

目前，我已经看到了一篇对ENCODE结论的批评性文章，发表在Current Biology上。我们实验室也从另外一个角度对之进行了批评，目前论文正在审稿，等论文在线发表后，我会写博客介绍一下我们为什么觉得ENCODE项目的结论太不靠谱，这个领域应该朝着哪个方向走。

我的博文都只是说，从他们的结果得出他们的结论太不靠谱。但为什么不靠谱，我没有详细说。感兴趣的网友除了看看著名生物信息学家Sean R. Eddy在Current Biology上的论文外，也可以用“ENCODE junk DNA 80%”最为关键词，用google查一下。除了宗教分子的欢呼和对ENCODE的新闻报道之外，就是进化生物学家对ENCODE项目组的批评和ENCODE项目组的辩解了。

1、时代杂志网站原文链接：http://healthland.time.com/2012/12/04/top-10-health-lists/slide/junk-no-more/


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