最新版Pymol2.3的效果

你是否发现Pymol新的版本已经下载不到安装版了？

你还在担心Pymol是商业软件不敢使用？

以下是Pymol官方网站对版权的描述。

“Open-Source Philosophy

PyMOL is a commercial product, but we make most of its source code freely available under a permissive license. The open source project is maintained by Schrödinger and ultimately funded by everyone who purchases a PyMOL license. 

Open source enables open science.
This was the vision of the original PyMOL author Warren L. DeLano.”

从此描述来看，Pymol是一个开源项目，这是其创始者Warren Lyford DeLano老先生一直坚持的。

你大可以放心的免费使用源码编译后的Pymol用于学术研究。 

当然，不要忘记了 致谢！

生物分子模拟论坛BioMS.org自2012年创办以来一直为大家分享Pymol的相关教程，并有专门的版面讨论Pymol的使用技巧，这里将持续更新最新编译的Pymol。

接下来我们将分享如何永久免费的使用最新版的Pymol了！

该方法支持三大操作系统Windows、Linux、Mac，

这里我们仅以Windows10操作系统为例，其它系统类似。

第一步：下载Anaconda

新手建议选择Python 3.6 Version

（如果你电脑中还有需使用Pyhon 2.7的软件，建议选用Python 2.7 Version，后续设置环境变量。）

https://www.anaconda.com/download/

第二步：安装Anaconda

建议新手在选项页面打钩。

（熟悉环境变量设置的朋友可以不用勾选，安装完后手动设置会更好。）

安装过程需要较长时间，请耐心等待。

第三步：下载Pymol

从BioMS.org论坛帖子的附件中下载最新的Pymol 2.3（ pymol-2.3.0a0-cp36-cp36m-win_amd64.whl）

下载地址：http://bioms.org/forum.php?mod=viewthread&tid=42337

第四步：安装Pymol

首先在下载了pymol‑2.3.0a0‑cp36‑cp36m‑win_amd64.whl的文件夹中，按住Shift键点击鼠标右键，点选“在此处打开Powershell窗口（S）”。

其次，在命令行输入“pip install pmw”。

然后在命令行输入“pip install pymol‑2.3.0a0‑cp36‑cp36m‑win_amd64.whl”。

最后，进入Anaconda的安装目录，找到Anaconda3\Scripts文件夹，里面有pymol.exe执行文件，做一个快捷方式放桌面吧！

第五步：运行pymol显示一个例子

双击pymol.exe打开程序，可以看到最新的2.3版本正常运行了。

下面是一个例子，PDB ID：2RGU，可以看到新版的pymol在使用ray命令后，背景自动透明，且无水印！

保存为png格式，如下图。

好了！现在你可以永久免费的使用最新版的Pymol了。

如果还有什么问题，欢迎留言讨论，或访问生物分子模拟论坛http://bioms.org研讨。

【分迪科技 PROTAC践行者】

期待与您合作！

028-85160035

sales@moldesinger.com

www.moldesigner.com

PROTAC蛋白降解药物【前世今生】系列

1、蛋白降解靶向嵌合体（PROTAC）新药开发系列【一】

2、【PROTAC】新药开发系列（二）降解MetAP2

3、【PROTAC】新药开发系列（三） 降解雌、雄激素受体

4、【PROTAC】新药开发系列（四） 透膜降解AR和FKBP12

5、【PROTAC】新药开发系列（五）  ——降解AR的“整体小分子”设计

欢迎阅读成功案例

1、千里姻缘一线牵：设计PROTAC治疗纤维化疾病

2、“解密”纳米材料包载药物的机制：分子模拟研究嵌段共聚物包载多西他赛

3、食品加工工艺机制研究: 高密度CO2诱导肌球蛋白自组装（上）

本文版权属于分迪科技，转载请注明出处，商业使用需取得分迪科技书面同意！

扫描二维码关注分迪科技微信公众号，更多前沿资讯！