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本期封面取材于中国传统文化元素——脸谱,通过脸谱的多姿多彩寓意非编码RNA种类、结构和功能的多样。
封面设计:胡煜
Science China Life Sciences(《中国科学:生命科学》英文版)2018年第2期出版了“Plant non-coding RNAs and epigenetics”专辑,介绍和探讨了植物领域不同类型非编码RNA及组蛋白修饰和DNA甲基化的作用和机制。专辑特邀编辑为中国科学院上海植物生理生态研究所王佳伟研究员和清华大学戚益军教授。
Review
1、microRNA-mediated R gene regulation: Molecular scabbards for double-edged swords
Deng Yingtian, Liu Minglei,Li Xiaofei, Li Feng(李峰)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),138-147 (2018)
阐述了抗病基因的发现、对作物育种的贡献及其对植物发育的潜在威胁,总结了植物miRNA对抗病基因的调控作用及其对生物与非生物逆境的响应,指出了靶向抗病基因的miRNA在抗病育种中的潜在应用价值。
2、Grass phasiRNAs and male fertility
Yu Yang, Zhou Yanfei, Zhang Yuchan, Chen Yueqin(陈月琴)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),148-154 (2018)
对近年来禾本科植物phasiRNA的生成机制、种类鉴定和功能研究等方面的进展做了系统性综述。
3、Transfer RNA-derived small RNAs in plants
Zhu Lei, Ow David W.,Dong Zhicheng(董志诚)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),155-161
综述了植物中tRNA来源小RNA的研究进展,分析了低等植物中tRNA来源的小RNA,并对其研究进行了展望。
4、RNA editing machinery in plant organelles
Yan Junjie, Zhang Qunxia, Yin Ping(殷平)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),162-169 (2018)
对参与植物细胞器RNA编辑发生的主要编辑因子如PPR蛋白、MORF蛋白等,从结构与功能、复合物组装与调控等方面进行了综述和展望。
5、Structure and mechanism of plant histone mark readers
Liu Rui, Li Xueqin, Chen Wei, Du Jiamu(杜嘉木)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),170-177 (2018)
从结构和功能两方面,对结构已报道的植物组蛋白标记识别因子特异性发挥功能的机理,特别是植物特有的组蛋白识别机制,进行了整理和系统性的总结。
Research Article
6、An expression atlas of miRNAs in Arabidopsis thaliana
Xu Le, Hu Yugang, Cao Ying, Li Jingrui, Ma Ligeng, Li Yan,
Qi Yijun(戚益军)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),178-189 (2018)
该研究全面和高深度的测序数据为今后更深入地了解miRNAs的功能提供了丰富资源。同时,揭示了成熟miRNA从其前体的哪一臂生成这一过程是受到发育时期及所在器官所调控的。
7、Conservation analysis of long non-coding RNAs in plants
Deng Pingchuan Liu Shu Nie Xiaojun Weining Song Wu Liang
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),190-198 (2018)
选取多个典型单子叶和双子叶植物,从结构和进化方面比较了植物lncRNAs特征,可为解析植物lncRNAs进化机制和生物学功能提供参考。
8、Arabidopsis noncoding RNA modulates seedling greening during deetiolation
Wang Yuqiu, Li Jian, Deng Xing-Wang(邓兴旺), Zhu Danmeng
(朱丹萌)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),199-203 (2018)
揭示了高等植物特有的长链非编码RNA HID1在光控植物发育中的新功能:HID1作为负调控因子参与了拟南芥黄化苗子叶见光变绿过程的精细调控。
9、A lariat-derived circular RNA is required for plant development in Arabidopsis
Cheng Jinping, Zhang Yong, Li Ziwei, Wang Taiyun, Zhang Xiaotuo, Zheng Binglian(郑丙莲)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),204-213 (2018)
通过构建套索RNA过表达的转基因拟南芥,揭示了套索RNA累积导致植物发育严重受阻的转录组的分子基础。
10、EARLY FLOWERING INSHORT DAYS (EFS) regulates the seed size in Arabidopsis
Cheng Lingling, Shafiq Sarfraz, Xu Wei, Sun Qianwen(孙前文)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),214-224 (2018)
发现组蛋白甲基转移酶EFS调节拟南芥种子大小,并影响部分印记基因的表达。
11、Histone 3 lysine 36 to methionine mutations stably interact with and sequester SDG8 in Arabidopsis thaliana
Lin Guang, Zhou Ying, Li Min, Fang Yuda(方玉达)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),225-234 (2018)
首次证明植物组蛋白H3K36M突变后能稳定结合组蛋白H3甲基转移酶SDG8,从而抑制SDG8的正常功能,造成过表达H3K36M植物发育异常。
12、Sumoylation of SUVR2 contributes to its role in transcriptional gene silencing
Luo Yu-Xi, Han Yong-Feng, Zhao Qiu-Yuan, Du Jin-Lu, Dou Kun, Li Lin, Chen She, He Xin-Jian(何新建)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),235-243 (2018)
发现拟南芥中一个参与RNA介导DNA甲基化的重要蛋白SUVR2能够被SUMO修饰,鉴定了它的修饰位点,并证明了该修饰对SUVR2生物学功能的影响。
13、Comparative WGBS identifies genes that influence non-ripe phenotype in tomato epimutant Colour lessnon-ripening
Chen Weiwei, Yu Zhiming, Kong Junhua, Wang Hui, Li Yichen, Zhao Mei, Wang Xiaohong,Zheng Qianqian, Shi Nongnong, Zhang Pengcheng, Zhong Silin, Hunter Paul ,Tör Mahmut,Hong Yiguo
(洪益国)
SCIENCE CHINA Life Sciences 61(2),244-252 (2018)
通过全基因组甲基化、转录组比较分析及VIGS功能验证,揭示了LeSPL-CNR及其它基因对番茄表观遗传突变体果实不成熟表型的影响。
专辑网址:
http://engine.scichina.com/publisher/scp/journal/SCLS/specialTopics/postArticles/5p7woNozh87ChBFQW
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