引用本文请注明出处：汉克·坎贝尔著；杨燕、王钰译  池呈校译. 科学2.0: http://www.science20.com/science_20/softwarex_scientific_software_gets_a_peer_reviewed_canonical_journal-153647#ixzz3XOUQMBYS.[EB/OL]. [2015-04-02].

尽管科学的公众形象是白大褂和试管，科学还担任着较少人熟悉的软件开发的角色。

通常情况下，在做一些需要完成的事情时并不需要工具，但经过了编写、测试和验证代码的辛苦工作之后，也仅仅是在某一行中提到作者所扮演的角色，很少有人会读到。^（1）

编程社区的妙处之一是，人们乐于分享——被称为GitHub的开源代码库里充满了实用程序、代码片段和成熟的项目，但你很难区分它们的好坏，除非你既是一个视读代码技能熟练的程序员又是一个科学家。和程序员一样，大多数科学家愿意分享，但是他们还没有付出高强度的努力去强调科学文献中程序的重要性，尽管这是自科学2.0运动开始以来的一个标志。

爱思唯尔正在利用SoftwareX填补这一空白，在SoftwareX这一同行评议期刊中，把科学软件视为科学生态系统的一个等同部分。其中，“X”指期刊的多学科目标，跨所有科学领域发布软件。在某种程度上他们对代码的态度就像使用他们的MethodsX出版对实验室书籍的态度——填补一个人人都觉得有价值的空白，只要有人能创建它。

而SoftwareX仅仅是一个很酷的名字。任何词加上一个X都变得更酷。你觉得下面哪个更酷，《比纳佛》（HMS Pinafore）还是战舰X（Battleship X）？^（2）

来源：吉尔伯特和沙利文。

来源：维基百科

就是这样。

是什么让我着迷于这个想法？除了那个显而易见的“以前从未有过那种类型的期刊”的方面，很可能与这个想法让很多人产生好奇的原因相似；为什么大公司价值30亿美元的STM部门开始创办这样的一份刊物，当创办一份能吸引更多活期利息和资金的名为《北美气候变化》或者其他什么名字的刊物更加有利可图时？

从来没有简单的答案，但有一个简单的事实：且不论如何被陷害，企业都不仅仅对赚钱感兴趣。企业在一些产品或在早期采用者上盈利，随后给某些规模较小的项目提供资金或者赠送一些东西，历史上这样的例子比比皆是。对全球变暖或癌症的买单行为，使得新刊物的出版不会存在过多的清账压力。

然后有时候事情发生，因为它有内在的冠军。尽管软件开发人员的地位很重要，但他们没有在科学领域得到学术方面的认可。没有软件，就没有高能物理学，据估计在任何给定时间都有三分之一HEP社区在开发软件，但进行论文写作时，代码总是事后才能想到。如果爱思唯尔内部人士看到了学术认可的缺乏，他们会找个理由满足这种需求。我选取了HEP但是我非常确定，如果我们与计算流体动力学的研究人员交流，他们也会有很多从未分享过的工具，因为没有好的分享方式。进入SoftwareX。

爱思唯尔希望能对科学软件工具进行同行评审，并且允许后续发布元数据和更新。在政府资助的科学界中，最重要的是这些工具现在可以方便地引用——且持续可用。这不是大学网站中研究生的个人主页，爱思唯尔是不会消失的。在开放存取同行评审科学代码的益处被定义为获取数据和结论的情况下，有多少科学家和程序员倾向于分享？大概是所有那些不偏执于竞争的人，就像开放存取数据那样。

尽管如此，资金是个难以忽视的问题。原因显而易见；所有人总说他们需要些什么，但是要让大家为这些东西付钱却很困难。我花了一百万美元来宣传科学2.0，而德国大学将会愉快地偷走我们所有的善意，通过贩卖挂着科学2.0名号的研讨会门票剥削与会者。只要能避免，学校就不会对此买单。

钱可能不是万能的，但没有钱却是万万不能的。

所以，为了知道爱思唯尔对于资金和其他事情的想法，我发了一封邮件给利奥诺拉•普雷萨妮（Eleonora Presani）博士，同时她也是新期刊的出版商。HEP的比喻在这非常贴切，因为在她职业生涯早期，她是一个高能物理学家。任何在实验物理学领域工作的人都知道你不会真的接触逆飞靶——一个铀原子核的横截面的百万分之一的百万分之一的千分之一——多元宇宙假设之外的物理学是软件密集型的，为了解释数以万亿次计的碰撞。然而除了“发现希格斯粒子！”和能量图，实验物理学领域之外的人没法知道这项工作是怎样完成的。

普雷萨妮说，你期望科学出版能够促进研究并被同行认可，但随后实践让我很吃惊：“我认为科学软件的市场不小，并且有巨大的潜力，因为科学界越来越多的人使用和开发软件，作为研究的必要组成部分。”

当然可以是这样。爱思唯尔没有把期刊和鲁尼•米奇－朱迪·加兰之“让我们表演！”系列电影画上等号，相反他们实际做的是来创造巴斯比·伯克利音乐剧；许多有才华、聪明的人一起工作，激发创意，给受众他们想要的东西。

但这并不意味着赚钱和好事不能一起发生。贡献在于“同行评审”与“引用和索引的目的”合为一体，这不仅是必要的，而且可能会大受欢迎，因为爱思唯尔让其具有了合法性。并且，尽管爱思唯尔储存这些，但拥有者仍然有所有权。它是开放存取，并在CC-BY许可下出版，但贡献者可以挑选许可。^（3）没有人为了软件或文章放弃著作权转让。

除了“这是一个市场吗？”另一个大问题是，同行评审是如何完成的？评审者有一个模版但普雷萨妮从更加实际的角度对它进行了充实。“对代码进行同行评审使得评估软件的科学影响极为重要。虽然作者应该证明软件编译和运行正确无误，但期刊确实专注于评估一段代码对科学的影响。”

对每篇科学论文来说几乎也是一样的情况。

“我不认为它与标准的研究文章有什么不同。虽然评审者评判研究发现的科学影响，但是理解研究的来龙去脉，例如希格斯玻色子的发现，对于个人来说是不可能的。”

在写这篇文章的时候，SoftwareX刚刚准备发布其第一批同行评审文章和代码。我很好奇地想看看响应。我预计，越是数字密集型的领域，如物理学，越会表现出兴趣。我知道，当我在物理软件公司时，许多学者会说他们能比我们做得更好。

这是一个展示的机会……并且也能得到一些学术认可。

备注：

（1）然而，在电脑上工作的人在其余时间会有一个非常棒的交易。

（2）或人口统计资料。当然，X一代比千禧一代更酷，因为X一代拥有Billy Idol，而千禧一代则只有数量惊人的伐木系男孩。

 X一代的乐队信贷：蛹唱片公司（ChrysalisRecords）。

通过科学盟友反科学的千禧年潮人。

（3）SoftwareX的推荐列表：

 Apache License, 2.0 (Apache-2.0)

•       BSD 3-Clause"New" or "Revised" license (BSD-3-Clause)

•       BSD 3-Clause"Simplified" or "FreeBSD" license (BSD-2-Clause)

•       GNU General PublicLicense (GPL)

•       GNU Library or"Lesser" General Public License (LGPL)

•       MIT license (MIT)

•       Mozilla PublicLicense 2.0 (MPL-2.0)

•       Common Developmentand Distribution License (CDDL-1.0)

•       Eclipse PublicLicense (EPL-1.0)

•       Creative CommonsZero (CC0)