沉闷科学的掘墓人分享 http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

博文

R语言批量替换系统发育树上序列名称_树文件专用_非平台版

已有 9740 次阅读 2015-3-30 17:02 |个人分类:我的研究|系统分类:科研笔记| R语言, 系统发育树, 序列名称, 批量替换, 树文件

#R语言批量替换系统发育树上序列名称_树文件专_非平台版

 

#作者信息

熊荣川

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

 

#预装函数(此函数代码将在发布24小时之后删除)

TreeNtrans <-  function(tree.pre,tree.pos,oldname, newname) {  

 ……

}

 

#使用方法

 

path = "……"

setwd(path)

tree.pre = "B_2.nwk"  #替换前的树文件

tree.pos =  "B_2_name2.nwk"   #替换后的树文件

oldname = "oldname.txt"  #旧的序列名称

newname =   "newname.txt"  #新的序列名称

TreeNtrans(tree.pre,tree.pos,oldname,  newname)

 

注意:序列名称不能重复,不能带冒号,逗号等

 

 




https://blog.sciencenet.cn/blog-508298-878484.html

上一篇:R语言下载序列并统计序列长度及物种信息
下一篇:如何在PowerPoint2010中设置广告公司可以直接打印的海报
收藏 IP: 61.159.186.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (1 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-24 19:11

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部