本地blast的bat批处理文件

#作者信息 

熊荣川 

六盘水师范学院生物信息学实验室 

六盘水市生物研究所

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

在生物信息分析，或者个发育分析中经常使用到NCBI本地blast

（例如ncbi-blast-2.2.27+）

但是一般让人望而生畏的是其非友好的使用界面

下面提供一个批处理文件，方便大家使用

代码如下

makeblastdb -in infile.fas -input_type fasta -dbtype nucl -title ORFtestGO -out outdb

#infile.fas 为你构建本地DNA数据库的fasta文件

#outdb 为你构建的数据名称

构建数据库-范例.bat