#作者信息

熊荣川

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

# 前言

蛋白质编码基因因为简并密码子的关系，使得三个密码子位置上的碱基进化速率存在差异，尤其是第三位密码子碱基。因此构建系统进化树之前常常需要按照密码子位置对基因进行分割，从而得到包含不同密码子位置碱基的数据集。下面简单介绍如何使用软件DAMBE进行分割操作

#使用方法

首先当然是比对好序列，并通过翻译成蛋白质的方法对基因进行核对

保存比对好的序列之后，导入DAMBE，注意选择基因类型和密码子表类型

在sequences选项中选择你要提取的序列位置

然后另存为其它文件即可

呵呵，真是不说不知道……

就这么简单，祝您科研愉快！