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R语言构建遗传距离似的矩阵表格
#作者信息 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz
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# 预装函数 #有时候我们需要做一组数据内部的两两比较,比较结果的呈现通常有两种方式,一种是类似于系统发育生物学上常常用到的遗传距离矩阵风格;另外一种则是双列式的表格。下面我们撰写的两个R语言函数分别能够完成两种风格矩阵的构建。 #原始代码已在发布24小时后删除。 | |||
#使用方法
Step 1 首先需要准备一个名录文件,.txt格式
Step 2 相关R函数应用 > taglist = readLines("taglistB.txt") > mat = Genetic_matrixA(taglist) > write.csv(mat,"Genetic matrix—方表.csv")
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GMT+8, 2024-9-23 21:40
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