沉闷科学的掘墓人分享 http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

博文

使用clustalX软件截取序列片段的方法

已有 6841 次阅读 2011-5-3 10:43 |个人分类:我的研究|系统分类:科研笔记| 片段, 序列, clustalX软件

使用clustalX软件截取序列片段的方法
 

 

 

我们经常遇到需要截取一条基因序列中的一段进行分析,例如线粒体全序中的某个功能基因片段。通常我们使用序列编辑软件操作,但是除了操作方法繁琐意外,还容易出错。下面我们将介绍一种使用clustalX软件截取序列片段的方法。

首先clustalX打开序列,在file菜单中选择save sequences as(图1

1

在弹出的对话框中,选择保存序列的文件格式,如fasta格式。点选“Use range information”(图2),填上起止核苷酸序号。值得注意的是需要改变文件名字,或者保存路径,软件默认保存在原来的文件夹,并以相同的文件名,所以容易将原来的序列文件覆盖,而我们只是截取了序列的一部分,从而是序列的信息量变的不完整。

图文版请参考附件

使用clustalX软件截取序列片段的方法.pdf

 



https://blog.sciencenet.cn/blog-508298-439832.html

上一篇:在win7中如何复制文件存放路径
下一篇:如何拼接12Sr rRNA、16S rRNA序列进行系统发育树构建
收藏 IP: 210.75.236.*| 热度|

1 唐常杰

发表评论 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-27 08:08

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部