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垃圾DNA验证的实验设计
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牛登科博主有文：2012年生物医学十大突破之首ENCODE，还有很大争议，请关注（http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=61772&do=blog&id=640581&cid=2317890）。既然有争议是不是能设计实验来验证下这个东西，没准是件好玩的事。当然，我是突发奇想，不为实验，只为搞笑，所以设计出来也不会去做的，没准有人去做，还真能弄个CNS之类的。
首先得明确垃圾DNA的概念，让它成为一个可以通过实验来验证的东西。
垃圾DNA的定义：从基因组里删除后不影响表型的DNA序列。
垃圾DNA的验证：
实验材料：水稻品种或者拟南芥或者其它方便得到纯系的材料，实验材料要有比较精确的全基因组序列，后面好分析。
实验方法：
1 对对照材料进行诱变处理，当然得用能产生插入缺失突变的诱变方法。获得诱变后代的纯系。纯系中和对照材料有明显表型变异的直接淘汰。
2 对和对照材料表型一致的后代进行高通量测序。
3 后代序列和对照材料进行序列比对，发现有缺失片段的后代，这个缺失的片段越大越好。
结论：缺失的片段是对照材料的垃圾DNA。
如果能找到足够大的垃圾片段，那么发个好文章应该是没问题的。
用这种方法可能发现维持表型不变的最小基因组。
绝对原创，如有雷同纯属知音偶遇或人家抄袭我的。是否有兄台愿一试否？当然最后一无所获我也是不负责任的，因开篇有言：不为实验，只为搞笑。
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