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CNS翻译练习:Nature. 2010 Jul 29;基因终点相关的人类RNA新的类别揭示了一种新的RNA复制机制

已有 3728 次阅读 2010-8-25 23:24 |个人分类:CNS论文摘要翻译|系统分类:论文交流

Nature. 2010 Jul 29;466(7306):642-6.



New class of gene-termini-associated human RNAs suggests a novel RNA copying mechanism.

Kapranov P, Ozsolak F, Kim SW, Foissac S, Lipson D, Hart C, Roels S, Borel C, Antonarakis SE, Monaghan AP, John B, Milos PM.



Helicos BioSciences Corporation, 1 Kendall Sq. Ste B7301 Cambridge, Massachusetts 02139-1671, USA. philippk08@gmail.com



Abstract

Small (<200 nucleotide) RNA (sRNA) profiling of human cells using various technologies demonstrates unexpected complexity of sRNAs with hundreds of thousands of sRNA species present. Genetic and in vitro studies show that these RNAs are not merely degradation products of longer transcripts but could indeed have a function. Furthermore, profiling of RNAs, including the sRNAs, can reveal not only novel transcripts, but also make clear predictions about the existence and properties of novel biochemical pathways operating in a cell. For example, sRNA profiling in human cells indicated the existence of an unknown capping mechanism operating on cleaved RNA, a biochemical component of which was later identified. Here we show that human cells contain a novel type of sRNA that has non-genomically encoded 5' poly(U) tails. The presence of these RNAs at the termini of genes, specifically at the very 3' ends of known mRNAs, strongly argues for the presence of a yet uncharacterized endogenous biochemical pathway in cells that can copy RNA. We show that this pathway can operate on multiple genes, with specific enrichment towards transcript-encoding components of the translational machinery. Finally, we show that genes are also flanked by sense, 3' polyadenylated sRNAs that are likely to be capped.







New class of gene-termini-associated human RNAs suggests a novel RNA copying mechanism.

基因终点相关的人类RNA新的类别揭示了一种新的RNA复制机制



Abstract

 使用多种技术揭示的人细胞小RNA(小于200核苷酸)的特性显示了成百上千种sRNA的未曾预料的复杂性。遗传学和体外实验显示了这些RNA不只是长转录片段的剪切产物,而可能事实上存在功能。此外,RNA的特性,包括sRNA,不仅能够揭示新的转录机制,而且还能清楚地预测新的细胞中生物化学通路的存在和特性。例如,sRNA在人体细胞中的特性提示了一种未知的在剪切的RNA上加帽的机制。剪切的RNA是后来被发现的一种生物化学组分。这里我们显示了人类细胞包含一种新型sRNA,它没有基因组编码的5'poly(U) 尾。这些RNA存在于基因的终点,特别是在已知mRNA的3'端,强烈提示了一种可以复制RNA的未知特性的细胞内生生物化学通路的存在。我们显示了这种通路可以操纵多个基因,特别是对于翻译机器的转录编码组分尤为丰富。最后,我们显示了这些基因有可能被加帽的敏感的3'多聚腺苷酸sRNA的侧翼。

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