我曾经翻阅一本大部头的英文医学书，序言的第一句话是医学（当然是指西医）不是科学。科学都是根据几条公理、定律，通过严密的的逻辑推理推导出来的理论体系。因此，中医与西医都不是科学。  因此，中国科学院没有医学研究所。 

当然，上述关于科学的定义是狭义的，或本初的。科学还有一个更加广泛的定义，也是大众广泛接受的定义（《现代汉语词典》给出的定义）：科学为反映自然、社会、思维等的客观规律的分科的知识体系。在这个定义下，医学就成了科学；也就有了社会科学。方舟子在这种意义下，说中医不是科学，言外之意，西医才是科学。方舟子是在机械唯物论的思维模式下，得出这个片面的结论的。中医是以中国的朴素辩证唯物论指导的科学，一种更加符合客观规律的科学。中医认为人体是一个复杂的体系，它自身有一套防病、抗病系统，当外邪入侵人体，如果这套系统不足以抗衡，变得不平衡时人就生病了。这时，中医用按摩、针灸、中草药来调整阴阳虚实的不平衡，而达到治病的效果。因此，中医也是科学，并且是一种更加高明的科学。 

说到人体是一个复杂的的体系，我要说几句关于钱学森提出的开展人体科学研究的提议。这也是一个受到方舟子等人猛烈诟病的提议。系统论是钱学森发展起来的一个科学分支。系统论认为复杂体系存在许多人们未知的知识，必须深入研究。人体是一个复杂的体系，因此要开展人体科学的研究。中国的中医把人体视为复杂体系，因此，钱学森认为中国开展人体科学研究有得天独厚的的条件。有些人把钱学森的提议曲解为耳朵听字、意志移物，那都是伪科学的闹剧。中医的经络与反射区，这些才是属于人体科学的成果。