在年度SCI论文发表数量上,中国科学院26921和美国加州大学31479有一拼，分别排第一和第二(2013年)。两家机构发表论文数量占国际全部数量的4.7%，可以代表国际学术发展的趋势。一个是国际头号科技强国最大的学术组织，另一个是国际科技大国的最大学术组织。学科分类虽然有区别，中国科学院在材料科学、地质、光学和植物学方面有比较强的优势，加大在神经科学、细胞生物学和天文学领域有更突出的表现，两家机构在物理化学等方面都比较强大（表6，7）。比较两大学术组织论文发表情况，也许可以窥探中美学术论文发表方面存在的差距和不同特点。

从发表论文杂志的情况看，除第一个Plos One以外，两大学术机构发表论文的杂志完全不同，美国加州大学在国际著名牛刊频繁发表论文，最著名的期刊例如PNAS、Nature、Science全部进入发表论文最多的杂志。而中国科学院发表论文最多的25本杂志似乎都不够档次。在国际著名四大综合期刊发表论文的数量，加洲大学分别为PNAS 561篇、Nature 193篇、Science 160篇和Cell 74篇。中国科学院分别为PNAS 86篇、Nature 37篇、Science 28篇和Cell 8篇。加洲大学显然远远超过中国科学院。比较有意思的是，加州大学发表的论文集中度并不大，年度发表超过100篇的杂志只有16本，而中国科学院则有32本杂志论文数量都超过100篇，说明两个机构在发表论文方面存在有意思的现象。在著名期刊中中国科学院学者特别偏爱的一个杂志是SCIENTIFIC REPORTS发表论文202篇（9），远远超过加州大学的114篇（14），这个可能说明一个问题，我们的科学家追求著名期刊的心情难得可贵，虽然这个期刊算不上特别牛，但出身高贵，前景光明。另外一个类似情况的杂志NATURE COMMUNICATIONS加州大学发表89，而中国科学院发表 67篇，比例适当。

从国际合作情况看，中国科学院和美国学者合作的比例确实比较高，但和其他国家合作的比例相对比较低，而美国加大和众多科技强国合作的程度非常高，这显然是由于大家都更愿意和美国学者合作的意向决定，在这方面是我们需要特别加强的。

表1.前5名发表论文最多的国际学术机构

机构扩展         记录         % of 1236967

1.         UNIVERSITY OF CALIFORNIA SYSTEM   31479       2.545

2.         CHINESE ACADEMY OF SCIENCES      26921       2.176

3.         HARVARD UNIVERSITY               17311       1.399

4.         UNIVERSITY OF LONDON                16013       1.295

5.         RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES         13615       1.101

表2加州大学发表论文最多的25本杂志

来源出版物   记录         % of 31481

1.         PLOS ONE                  1022     1.766

2.         PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA                  561         0.969

3.         ASTROPHYSICAL JOURNAL    453  0.783

4.         PHYSICAL REVIEW LETTERS   304  0.525

5.         PHYSICAL REVIEW B            268  0.463

6.         PHYSICAL REVIEW D          223     0.385

7.         JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY        212  0.366

8.         APPLIED PHYSICS LETTERS     203  0.351

9.         MONTHLY NOTICES OF THE ROYAL ASTRONOMICAL SOCIETY    203  0.351

10.     NATURE   193  0.333

11.     JOURNAL OF NEUROSCIENCE         173         0.299

12.     SCIENCE   160  0.276

13.     JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY115         0.199

14.     SCIENTIFIC REPORTS                   114  0.197

15.     JOURNAL OF HIGH ENERGY PHYSICS     111  0.192

16.     JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS         108  0.187

17.     ASTROPHYSICAL JOURNAL LETTERS     98     0.169

18.     JOURNAL OF GEOPHYSICAL RESEARCH SPACE PHYSICS       94     0.162

19.     JOURNAL OF APPLIED PHYSICS          92     0.159

20.     ENVIRONMENTAL SCIENCE TECHNOLOGY    89     0.154

21.     NATURE COMMUNICATIONS    89     0.154

22.     JAMA INTERNAL MEDICINE       84     0.145

23.     PHYSICS OF PLASMAS           83       0.143

24.     NANO LETTERS                   82       0.142

25.     PLOS GENETICS                  81       0.140

表3中国科学院发表论文的前25本杂志

来源出版物   记录         % of 26921

1.         PLOS ONE        673  2.500

2.         APPLIED PHYSICS LETTERS     288  1.070

3.         CHEMICAL COMMUNICATIONS      284  1.055

4.         RSC ADVANCES        258  0.958

5.         ACTA PHYSICA SINICA    225  0.836

6.         CHINESE SCIENCE BULLETIN   224  0.832

7.         JOURNAL OF MATERIALS CHEMISTRY A        220  0.817

8.         JOURNAL OF APPLIED PHYSICS      213  0.791

9.         SCIENTIFIC REPORTS       202  0.750

10.     NANOSCALE    184  0.683

11.     CRYSTENGCOMM   176  0.654

12.     CHINESE PHYSICS B         165  0.613

13.     ACS APPLIED MATERIALS INTERFACES  158  0.587

14.     PHYSICAL REVIEW D       151  0.561

15.     ASTROPHYSICAL JOURNAL    149  0.553

16.     JOURNAL OF ALLOYS AND COMPOUNDS     138  0.513

17.     OPTICS EXPRESS     137  0.509

18.     CHINESE PHYSICS LETTERS     133  0.494

19.     CHEMISTRY A EUROPEAN JOURNAL     129  0.479

20.     DALTON TRANSACTIONS        125  0.464

21.     CHINESE JOURNAL OF GEOPHYSICS CHINESE EDITION        123  0.457

22.     ANGEWANDTE CHEMIE INTERNATIONAL EDITION      122  0.453

23.     JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C   121  0.449

24.     SPECTROSCOPY AND SPECTRAL ANALYSIS   118  0.438

25.     JOURNAL OF MATERIALS CHEMISTRY C        116  0.431

41.    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA  86     0.319

表4中国科学院国际合作论文情况

国家/地区      记录         % of 26921

PEOPLES R CHINA   26921       100.000

USA3503         13.012

GERMANY        986  3.663

JAPAN      784  2.912

ENGLAND         781  2.901

AUSTRALIA     740  2.749

CANADA593  2.203

FRANCE   555  2.062

ITALY        392  1.456

TAIWAN  376  1.397

表5. 加大国际合作论文情况

国家/地区      记录         % of 31481

USA31481       100.000

PEOPLES R CHINA   2296         7.293

GERMANY        2293         7.284

ENGLAND         2069         6.572

CANADA1832         5.819

FRANCE   1565         4.971

ITALY        1311         4.164

AUSTRALIA     1151         3.656

JAPAN      1111         3.529

SPAIN       1070         3.399

表6 加大10大研究方向

研究方向        记录         % of 31482

PHYSICS   3442         10.933

SCIENCE TECHNOLOGY OTHER TOPICS2924         9.288

NEUROSCIENCES NEUROLOGY       2331         7.404

CHEMISTRY     2266         7.198

ENGINEERING2043         6.489

BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY         1990         6.321

ENVIRONMENTAL SCIENCES ECOLOGY1566         4.974

ASTRONOMY ASTROPHYSICS        1386         4.403

MATERIALS SCIENCE       1292         4.104

CELL BIOLOGY          1083         3.440

表7 中国科学院10大研究方向

研究方向        记录         % of 26930

CHEMISTRY     6337         23.531

PHYSICS   5153         19.135

MATERIALS SCIENCE       3786         14.059

SCIENCE TECHNOLOGY OTHER TOPICS2739         10.171

ENGINEERING2535         9.413

ENVIRONMENTAL SCIENCES ECOLOGY1994         7.404

BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY         1253         4.653

GEOLOGY         1170         4.345

OPTICS     1127         4.185

PLANT SCIENCES     845  3.138