Local BLAST （Basic Local Alignment Search Tool：BLAST finds regions of similarity between biological sequences. The program compares nucleotide or protein sequences to sequence databases and calculates the statistical significance.）      

   相关资料链接：

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download

包含安装软件下载地址、使用说明、数据库等

Linux下的标准安装流程：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52640/

也可以:

1. 直接在终端下载ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/中的**.tar.gz文件：

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.7.1+-x64-macosx.tar.gz

 2. 解压：tar zxvpf ncbi-blast-2.7.1+-x64-macosx.tar.gz

 3. 修改路径，全局调用：

export PATH=$PATH:/opt/ncbi-blast-2.7.1+/bin

echo "export PATH=/opt/ncbi-blast-2.7.1+/bin:\$PATH" >> ~/.bashrc

 4. 配置数据库的位置：

export BLASTDB=/home/WL/blastdb
echo "export BLASTDB=/home/WL/blastdb" >> ~/.bashrc

 5. 试运行,查看是否安装成功

blastn -version

关于数据库文件的下载，推荐使用迅雷下载后解压，如*.nr等一系列。对于自己感兴趣的基因集，可以在ncbi网站上搜索目标后保存ID序列号，结合Batch entrez（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez）批量下载数据， 让后利用makeblastdb命令构建自己的序列数据库。