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第三代测序(Third-generation sequencing,TGS)技术,如便携式微型测序仪,有望彻底改变生物学,但是,TGS测序仪的低输出意味着必须开发靶向DNA测序,以确保对感兴趣的区域进行适当的测序覆盖。在最近一期的植物科学应用研究中,Thomas Couvreur博士和他的同事们开发了一种新的方法来对植物中的长的质体DNA片段进行捕获和测序。
Couvreur博士和他的同事们对利用一种称为靶向测序(targeted sequencing)的技术捕获和测序叶绿体DNA的长片段很感兴趣,这种技术在植物中从未被用于长DNA片段。他们设计了用于捕捉这些长序列的探针,并在六种单子叶植物中进行了测试。靶向测序结合TGS技术可以改善基因组组装,或者将许多测序的DNA片段拼接成更大的连续块。
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/08/190805181632.htm
Journal Reference:
Kevin Bethune, Cédric Mariac, Marie Couderc, Nora Scarcelli, Sylvain Santoni, Morgane Ardisson, Jean‐François Martin, Rommel Montúfar, Valentin Klein, François Sabot, Yves Vigouroux, Thomas L. P. Couvreur. Long‐fragment targeted capture for long‐read sequencing of plastomes. Applications in Plant Sciences, 2019; 7 (5): e1243 DOI: 10.1002/aps3.1243
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