本资源来源于：化学吧

相信大家自己的专业文献都有一大堆,用的时候却不知道在硬盘的那个角落,因此,有效的文献管理就成为必要.最近自己也为这些问题所苦恼,于是搜索解决办法,发现大受推荐的有end note与note express两款,因为是刚开始用,所以所知甚少,发此帖的目的一方面是转贴一些收集的此类信息,另一方面也向这方面的能手学习!
note express 可在 http://www.SciNote.com 下载
end note比较多,emuch 也有下载地址!
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推荐: Endnote X中文用户手册

下载地址: http://biotech.ustc.edu.cn/upimg/endnote/EndnoteXuserguide.rar
        NoteExpress参考文献管理软件简要教程
               下载地址:http://www.scinote.com/supportcn ... 576-NoteExpress.rar

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转贴一些行家的心得:

1 NoteExpress与Endnote与Biblioscape的比较

这是两个外国品牌。一两年之前在中国，这两个软件几乎就是参考文献管理软件的代名词。近期国产软件崛起，其影响才略微衰减。这种状况，老外并不大清楚。前不久，在波士顿大学国际考古中心同老美偶然谈起Endnote，他们竟很惊奇中国人对这个软件的熟悉。

Endnote和Biblioscape的基本功能，应该说都差不多。即可以检索那些生物、医学专业数据库，导入数据（国产数据库只有通过一些间接的方法导入或者自己录入），并在WORD中导出数据。配合Styles，可设定各种期刊的投稿模式及相应的参考文献格式，并且有分析文献的 功能。另外还支持题录与全文的链接，能够在需要时调用全文。其详细用法，不烦赘述。有兴趣的谈友可以查看一些详细的介绍。如果想用汉化版，也可向辄止要汉化补丁。辄止作这些补丁，一方面是E文不行，在E文界面常常犯晕。另一方面也是为了在丁香园挣点工分。

这两个软件的区别，有一点非常明显。就是Endnote是将所有题录放在一个数据库中。如果想作不同专题的题录，需要建立不同的数据库。Biblioscape则可在一个库下，对题录分类、分层管理，非常符合研究之需。辄止在试用之后，第一感觉是后者更适合自己的需要。

不过，在进一步使用之后，发现Biblioscape有一个致命的问题，就是对中文支持不好。通常以为，Biblioscape对中文的支持比Endnote，其实不然。Endnote在7.0以前，对中文不支持。近年升级频繁，8.0、9.0对中文支持越来越好。Biblioscape升级极慢，6.5版从今年3月至今，未见升级。以辄止的经验，这个最高版本（6.5）在中文的支持上，比Endnote8、9明显要差。这里不妨试举二例：在作者排序时，裘姓（这可是辄止常常引述到的一个姓呵）、邴姓不能按拼音正确排序。有的人名最后一字在格式化时，也会出错。比如：


辄止给程序编制者去信，方知这是因为软件不支持unicode而引发的。据云，这类问题需要到version8解决。可现在还是6.5，什么时候才能升级到8.0呢？真是“俟河之清，人寿几何”。

2 医学文献王NoteExpress

作为国产文献管理软件，医学文献王是最早取得成功的。软件开发商北京金叶天翔科技有限公司自诩“国内第一款（参考文献）管理软件”，似非虚言。它比较普及的版本是1.3,最新版本已是2.0。

文献王综合了Endnote、Biblioscape二者的特长，中文界面，并且在数据获取和输出格式上实行本土化，因而赢得不少医学从业人员的喜爱。
其特点可归纳为以下三点：

1，数据分类、分层管理。用户可自行添加或删除数据文件夹，可以在不同文件夹之间实现数据的移动。这显然是借鉴了Biblioscape的作法。
2，用户可方便地将检索到的数据导入。这里特别应该说到的，是在检索CNKI（中国期刊网）的时间，可以通过点击鼠标右键，将检索到的数据轻易导入。当然，这样导入的数据，对医学、生物专业人员来说，还不够详细，所以出现一些用户自己编辑的导入滤器。但对于历史专业的人士而言，已经足够了。
3，可以比较方便地与Endnote、Biblioscape软件交换数据。
不过，文献王也有令人头痛的地方。
首先，其运行较慢，与WORD兼容似乎有些问题。据说，新版本已经有大改善。不过，辄止还没有试用，不好妄言。
其次，它的输出格式只有尾注一种，无法用于脚注。辄止想象这是撰写医学文献的规则，但对文科用户而言，这却是一个致命伤。因为我们固然有时用尾注，但更多的时候需要用脚注。当然，人家本来就是“医学文献王”，是辄止自己好事要去招惹它。
看到这种情形，辄止不多加思索，便放弃了长期使用文献王的打算，转而将眼光投向国产文献管理软件中的黑马——NoteExpress。

下面是该软件的功能介绍
NoteExpress是北京爱琴海软件公司(http://www.AegeanSoftware.net)开发的一款专业级别的文献检索与管理系统，其核心功能涵盖“知识采集，管理，应用，挖掘”的知识管理的所有环节，是学术研究，知识管理的必备工具，发表论文的好帮手。产品主页地址：http://www.SciNote.com

NoteExpress具备文献信息检索与下载功能，可以用来管理参考文献的题录，以附件方式管理参考文献全文或者任何格式的文件，文档。数据挖掘的功能可以帮助用户快速了解某研究方向的最新进展，各方观点等。除了管理以上显性的知识外，类似日记，科研心得，论文草稿等瞬间产生的隐性知识也可以通过NoteExpress的笔记功能纪录，并且可以与参考文献的题录联系起来。在编辑器（比如MS Word）中NoteExprss可以按照各种期刊杂志的要求自动完成参考文献引用的格式化-------完美的格式，精准的引用将大大增加论文被采用的几率。与笔记以及附件功能的结合，全文检索,数据挖掘等，使该软件可以作为强大的个人知识管理系统。
NoteExpress的主要功能可以列举如下：

1 题录采集
1）从互联网上数以千计的国内外电子图书馆，文献数据库中检索，下载文献书目信息，软件内置多线程，是同类软件中下载速度最快的。以后将提供用户自己添加，管理这些连接的功能。
2）可以从全球最大的在线书店Amazon的资料库中检索，下载题录信息。
3）从硬盘本地文件中导入用户以前搜集的各种的文献资料题录，速度比国外同类软件快10倍以上（参考文献的全文可以通过附件管理）。
4）手工添加。

2 题录管理：
1）检索方便，检索结果可以保存下来作为一个研究方向专题。
2）数据库容易携带，备份。

3 题录使用：
1）快速检索和浏览，以了解研究方向的最新进展。
2）NoteExpress的核心功能之一就是在学术论文、专著或研究报告等的正文中，按照国际通行惯例，国家制定的各种规范，期刊杂志要求的各自的规范(可由用户自己编辑规则),在正文中的指定位置添加相应的参考文献注释或说明，进而根据文中所添加的注释，按照一定的输出格式(可由用户自己选择)，自动生成所使用的参考文献、资料或书目的索引，添加到作者所指定的位置（通常是章节末尾或者文末）。目前在同类软件中，NoteExpress的word插件的性能最好。

4 笔记功能：
可以为正在阅读的题录添加笔记,并把笔记和题录通过链接关联起来,方便以后阅读。
5 任意格式的附件和文献全文，电子书管理：
题录，笔记与附件功能结合，可以把该软件作为个人的知识管理系统。参考文献的全文也是作为题录或者笔记的附件来保存。

3 NoteExpress的数据添加

谢谢wedfast007兄讲解NoteExpress的基本操作。辄止技痒，想谈得更具体一点。因有此文。
NoteExpress（暱称NE）数据添加，是最基本的操作。
这大致有三种办法。
第一，手工录入 这是最无奈的作法。在References中选定或添加需要的目录，然后在题录框点鼠标右键，新建题录。选择题录类型，再按需要逐项填写。以辄止体会而言，作为初用者，这里有几点需要注意。一是题录类型要准确，如“期刊文章”、“书”、“学位论文”等等。辄止颇感不便的是没有“电子文档”一类，以收录如“简帛”、“简帛研究”等网站的文章。只好用“通用”代替。二是所有题录类型的字段都没有月份、日子。在处理书籍时，想加入月份数据；处理网站文章时，想加入月、日，都没有现成的位置。辄止无奈，只好以“日期”字段充用。相应地，网站文章网站名也没有现成的地方填写，辄止是放在“期刊”中。网文详细地址倒是有“链接”现成的字段。如果大家不反对的话，以后作简帛的朋友是不是也参照辄止这个选项。只有一致，今后才能方便地交换数据哦。
一条数据录入之后，点按上端三个按钮中的中间一个，保存并退出。如果再要录入下一条，循环进行就行了。
第二，从数据库中检索导入 对作简帛、作中国古代史的朋友而言，有三个数据库常常用到。一是CNKI即中国期刊网（最时髦的叫什么”知网’），二是北京大学，三是北图联合编目中心。
先说CNKI。目前开发者推荐的，是先在CNKI中检索，批量选中所欲添加的题录，保存题录，另存为文本文件，再用开发者提供的 Filter导入。或者在保存题录后，全选，拷贝，再在导入题录中选择“来自剪贴板”，导入即可。需要注意的是，CNKI的版本很多，只有使用相应的 Filter才能正确导入。这方面，可以到http://www.scinote.com/supportcn ... amp;bpg=1&age=0下载视频来看。
其实还有一种比较简易的方法。就是先用医学文献王，用其鼠标右键的保存功能，将保存下来的题录导入至文献王，再导出，再导入至NE。这实际上涉及到第三个方法了。
北大、北图的数据，是关于图书的。可以批量检索、导入。比如可以拿“简牍”、“楚简”、“秦简”或者某位学者名作关键词，检索起来，结果一批一批的。辄止还用“中华书局”、“文物出版社”作关键词，命中的书目更多。不过，这种检索总是有问题，有些常见书也可能出不来。要当心哦。
第三，从别的文献管理程序中转入 如果自己或朋友有现成的数据，就可以免掉很多麻烦。如果也是NE的数据，可以直接打开，再作其他处理。如果是其他软件，NE作好了对应的Filter，只要正确地导出、导入，就可以了。


4 NoteExpress的题录引用
应该补充说明一下，题录就是我们通常所说的文献。因为这不是文献本身，而是文献的标题及相关信息，NE开发者叫它题录，也许更恰当。
我们大家作题录库，一个心照不宣的意图，是为了在写作时，能即时插入需要的题录。而不要到那时才一一翻检并且逐个输入。
在NE中设计中，题录插入主要是靠Word插件完成。虽然这个功能对我们这个行当来说，基本上是个无用的累赘，但还是介绍一下为好——不然开发者可能会感到委屈。
NoteExpress正确安装，重新启动word后的NoteExpress工具栏如下图所示：

通过NoteExpress菜单“菜单--->选项 --->Word 插件”，也可以启用或者停用这个插件——建议在对这个工具栏感到心烦时立即执行“停用 ”。
点击NoteExpress的References（题录）文件夹或其子文件夹，选中题录列表中的一条或多条题录（reference）——这个选择也可以通过搜索实现，尤其当题录太多时——回到Word窗口，在文档需要插入题录信息的位置，点击工具栏上的“插入引文”。
点击工具栏上的“格式化参考文献”按钮，在出现的“格式”窗体中选择要使用的输出样式，点“确定”按钮，完成引文格式化。
如果需要撤消“格式化参考文献”的结果，点击“引文及参考文献去格式化”按钮。
如果引入论文中的某些参考文献信息的格式化已经完成，而不想被再次改变，可以先在文中选中之，然后点击“清除所有域代码”按钮。清除所有域代码后，再点击“格式化参考文献”或 “引文及参考文献去除格式化”时，对本篇文章中该文献信息不再产生影响。
辄止不得不说明的是，这个功能看上去很美，实际上用处并不大。因为它所产生的题录，只有尾注一种——辄止更愿意把它看作文末的参考文献，而不能用作脚注。
如果不是因为有另外一种补充，辄止也会象舍弃文献王那样立即舍弃NE——谁愿意花费精力伺候一个精美的废物呢？
这个补充方法，是NE的“格式化拷贝”。当我们选中所欲插入的题录后，按鼠标右键—格式化拷贝（嘻嘻，这个功能是应辄止建议而作的哟），再转到WORD文档的插入点粘贴，一条题录就插入了。这样的插入位置是可以自己随意选择的，当然我们会比较多地用于脚注或尾注。
如果有朋友在这时已经用NE在尝试，也许会说：这个格式不是我所需要的。没关系，下回辄止会具体地介绍格式处理。


5 NoteExpress输出样式编辑
在引述题录时，样式（Style)很重要。通过工具—输出样式—选择输出样式，将需要的题录输出样式确定下来，才能使文档中的引述题录符合投稿对方的要求。
不同的刊物、出版社，对注释的要求往往有异。NE大概会通过逐渐积累，建立国内外一些常见刊物对文献征引的样式。不过，在目前阶段，用户自建样式是不可避免的。今后NE输出样式多起来，也不可能包罗万象，有时还是会要自己动手。
编辑输出样式，其实比较简单。通过工具—输出样式—输出样式管理器，可以自由地改造或创建样式。下面先说创建。
点击新建，进入样式编辑器，选择参考文献—模板。点击“题录类型”按钮，选择适合的类型，如通用、期刊文章、书。这时编辑框中出现相应以“通用”、“期刊文章”或者“书”为名的编辑条。然后多次点击“插入字段”按钮，在需要的位置选择字段，如“作者”、“期刊”、“标题”、“年份”、“期”等等，并在其间按需要输入标点、插入分隔符（目前版本分隔符有问题，开发者已承诺改进），然后保存。保存时会提示文件名，输入你所定义的期刊或样式名即可。
改造是利用现有样式来作的。在管理器中选择一个与需要近似的模板，对其加以改造，以符合自己的需要。这样会简单一些。但辄止发现这样作会有一点麻烦，即采用这样作出的样式引用题录时，会出现多余的段落标记，需要一一删去。
在同行之中，样式往往相同。因此，朋友之间可以把作好的样式交换。最直接的方法，是在样式目录（NoteExpress/Styles）将其拷贝出来，放到对方这一目录，再在样式管理器中按“刷新”，这个样式即可显示出来，并为你所用。
NE中许多场合不能即时更新，而是需要手动刷新，这应该说是不便之处。以后大概会改进。

6 NoteExpress中的题录操作
NoteExpress中的题录操作，说实话，辄止对其中有的功能也没有弄得太清楚，以其昏昏，使人昭昭，不免战慄。
在NoteExpress的题录框中，点击鼠标右键操作或者在工具栏的题录栏中，都有新建题录、编辑题录、删除题录、为题录新增笔记、格式化拷贝、标记以及移动到文件夹、链接到文件夹、复制到文件夹等指令。
1、新建题录 这个辄止已经说过了。详见“四、NoteExpress的数据添加 ”的“第一，手工录入”。
2、编辑题录 这通常是在现有题录需要修改时的操作，方法同上。
3、删除题录 这个最简单，选定欲删除的题录，点击删除，确定，一条或者一批题录就不复存在。作起来痛快，但可要小心哦。
4、为题录新增笔记 这是NE的特别设计。选定欲建立笔记的题录，为题录新增笔记，为新笔记拟定一个文件夹，在出现的日记编辑界面编辑笔记。这个过程也可以是逆向的。即先在右侧的数据库框中点选Notes，出现笔记编辑界面，再书写笔记。需要时将笔记链接到题录。恕辄止直言，对辄止而言，这种功能并不特别实用。等你题录、笔记都很多的时候，如何顾得过来。像在其他文献管理程序那样，将笔记建在题录中，老老实实地一条题录、一条笔记，好象更实用。
5、格式化拷贝 这实际上是对题录的引用，说见“五、NoteExpress的题录引用”。
6、标记 这是给题录作标记。选项有从0到4，共5项。其含义由我们自己赋予。比如，我们可以把0看作无，把1看作有（即自己是不是有其全文）。还可以进一步把1看作有纸质文档，把2看作电子文档。
7、移动到文件夹 选定题录，移动到文件夹，指定欲移至的文件夹，所选题录便在原文件夹中消失，而存在于所移至的文件夹中。
8、链接到文件夹 选定题录，链接到文件夹，指定欲链接的文件夹，所选题录便同时存在于原文件夹和新链接的文件夹中。
9、复制到文件夹 选定题录，复制到文件夹，指定欲复制的文件夹，所选题录便同时存在于原文件夹和复制到的文件夹中。
辄止先前说“不清楚”的，就是“链接到文件夹”与“复制到文件夹”在实质上有何不同。所幸Murphy_NE（NE技术支持）已经屈尊光临论坛，或许我们可以指望他来帮我们说明一下。

7 NoteExpress的搜索与查重
1)搜索
NE的搜索功能作得简单实用。点选欲搜索的文件夹——References或者Notes，在搜索对象框中输入欲搜索的字段（作者、标题、关键词等等），回车，满足条件的题录或笔记，就会全部列出。
NE还设有Seachers文件夹，其中Recently Seachers中保留有最近搜索的结果（保留的个数可在工具—选项中自己定制。
NE的搜索也有不足，就是不能缩小范围，比如仅仅在References中的某个子文件夹中搜索。因而也多少有点不便。
2）查重
NE的查重功能是新近增设的，显然还不够成熟。用法是：工具—查找重复题录，在待查重文件夹中选定欲查重文件夹，在待查重字段中选定字段，按查找，重复的题录便显示出来。你可以将重复题录中的不需要者删除。
辄止初步测试，目前版本这个功能的问题有三：
第一，虽然可以选定子文件夹，但实际查找范围仍然是整个References。所以我们毋需按照名义上的标示去作选择子目录这种无用功。
第二，查找结果不是按作者排列。
第三，也是最重要的，辄止无从了解这些重复的题录属于哪一个子文件夹，从而也就难于判断是重复录入，还是有意为之（比如通过复制和链接功能有意建立的重复题录）。在Biblioscape中有一个非常贴心的设计，就是我们可以通过鼠标右键，查看任一题录属于哪个文件夹。这是值得NE尽快师法的。



国产文献管理软件noteexpress!ZT

硬件平台：Dell Inspiron 710m 笔记本电脑，CPU 1.7G，内存512M，硬盘60G（5400转）
软件平台：中文Windows XP SP2，EndNote 9.0.1（Bld 1748），NoteExpress 1.8.0.163

初始的记录来源：由PubMed Web检索到的26362条记录，并以MedLine格式保存下来的文本文件，文件大小63.2 M。

测试内容：
一、EndNote
1.  运行EndNote，创建并保持打开一个空的aaa.enl记录库，EndNote.exe占用内存16,244 K。关闭EndNote.exe，得的一个0K的aaa.enl文件和43.6K的aaa.Data目录，总共43.6K。
2.  导入上面的26362条记录到EndNote，所花时间3分15秒，得到一个43.8M的aaa.enl文件和50.4M的aaa.Data目录，总共94.3M。导入过程中，CPU使用一直徘徊在100%，但可轻松切换到其它程序并进行操作。
3.  关闭aaa.enl，再重新打开，花费时间1秒，打开后EndNote.exe占用内存18,384 K。
4.  将26362条记录以EndNote Export格式导出，花费时间1分6秒，得到一个47.8M的文本文件。
5.  再往aaa.enl库里导入上面的26362条记录，花费时间3分25秒，保存关闭EndNote后，查看aaa.enl文件为87.7M，aaa.Data目录为94.8M，总共182M。
6.  再次打开aaa.enl，花费时间2秒不到，里面记录52724条。
7.  在52724条记录里的任意字段Any Field查找一个关键词，得到140条结果，花费时间3秒。
8.  在52724条记录里以Author，Year，Title，Journal Title和Reference Type为组合比较字段查找重复记录，查找到26394条记录并自动选中，费时14秒。
9.  删除掉这些重复的记录，关闭EndNote，查看aaa.enl文件为43.8M，aaa.Data目录为50.3M，总共94.2M。

二、NoteExpress
1.  运行NoteExpress，创建并保持打开一个空的bbb.ned记录库，NoteExpress.exe占用内存13.988 K。空的bbb.ned文件大小42K。
2.  导入上面的26362条记录到NoteExpress，所花时间5分26秒，得到一个202.0M的bbb.ned文件。导入过程中，CPU使用一直徘徊在100%，而硬盘灯则一直保持亮着（在保存记录），切换到其它程序并操作显得很困难。
3.  关闭bbb.ned，再重新打开，花费时间1秒，打开后NoteExpress.exe占用内存34,768 K。
4.  将26362条记录以RefMan(RIS) Export格式导出，此过程CPU使用一直徘徊在100%，PF使用居然达到1G，而硬盘灯则不停地闪烁，时间过了30分钟还没完成，等不下去了，只好用任务管理器强行结束进程了。看来“导出题录”这个功能模块的程序代码编写有问题。
5.  再往bbb.ned库里导入上面的26362条记录，花费时间7分10秒，保存关闭NoteExpress后，查看bbb.ned文件为404.0M。
6.  再次打开bbb.ned，花费时间约3秒，里面记录52724条。
7.  在52724条记录里的标题、关键词和摘要字段中查找一个关键词，花费时间1分20秒，只显示检索到的记录列表，没提示总共检索到多少条记录，保存检索返回到主界面，重新点击左边栏的检索->最近的检索->检索历史，才显示列表并在列表右上角提示138条记录（此时又需要等待一会儿，没有计时，好像是又重新检索了一遍）。
8.  在52724条记录里以作者、年份、标题和期刊为组合比较字段查找重复记录，10分钟过去了，查找进度条才走三格，实在是没耐心等它查完，直接任务管理器强行结束进程。
9.  打开404.0M，含有52724条记录的bbb.ned，选择“压缩数据库”功能，5分钟过去了，鼠标还是保持漏斗状，没有进度条显示，不知还要等多久，只好强行结束NoteExpress.exe进程了。

结论：
NoteExpress在文献管理功能的规划上比EndNote周全，但在程序算法、代码的编写上，还有待改善、提高。