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中国农业大学张力群教授、刘俊峰教授与吉林大学罗招庆教授团队的合作研究“The toxin–antitoxin complex Fic‐1–AntF functions as a deAMPylase that regulates the activity of DNA gyrase”已在 mLife 正式上线。该团队基于毕节假单胞菌(Pseudomonas bijieensis)2P24中Fic-1-AntF TA 对的研究发现,与传统观点认为的抗毒素的作用仅仅是中和同源毒素的活性不同,抗毒素 AntF 不仅能抑制毒素 Fic-1 的活性,还能与毒素协同,作为一种去单磷酸腺苷化酶(deAMPylase),逆转毒素对靶标蛋白的修饰,从而调控细菌自身的生理状态。该研究揭示了一种细菌毒素活性调控的全新范式。

毒素-抗毒素系统(Toxin-Antitoxin system, TAs)是细菌应对环境压力、调控自身命运的重要工具。毒素Fic-1(200 aa)属于 Fic(filamentation induced by cAMP)蛋白家族,该家族成员广泛分布于细菌中,常作为细胞分裂的调控开关。该研究表明,Fic-1具有单磷酸腺苷化(AMPylation)酶活性,其靶标为细菌DNA复制关键酶DNA促旋酶(DNA gyrase)的β亚基(GyrB)。Fic-1 在 GyrB 的特定酪氨酸残基(Tyr109)上共价连接一个单磷酸腺苷(AMP)基团(图1),阻碍了GyrB与ATP的结合,从而抑制DNA复制,引发细菌的 SOS 应激反应,并最终导致细菌无法正常分裂,形成长丝状体(filamentation)甚至死亡。
fic-1 基因上游紧邻一个小蛋白编码基因antF,其产物 AntF(56 aa)被鉴定为该系统的抗毒素。AntF与 Fic-1 形成稳定的异源复合物,中和其细胞毒性。但这种结合并非仅仅是“封存”毒素那么简单。通过结构与生化分析显示,Fic-1-AntF 复合物本身具有去单磷酸腺苷化酶活性,能够将Fic-1之前加在GyrB 上的 AMP 基团切除,使 GyrB 恢复到未被修饰的天然状态(图1)。进一步的遗传学实验揭示,AntF 蛋白上的 Glu28 位点对于该催化功能至关重要。

图1. Fic-1-AntF TA 系统对细菌 DNA 复制的调控模式
这种“一酶双能”的现象并非细菌独有,在真核生物中同样存在。哺乳动物细胞中唯一编码的 Fic蛋白 FICD(又称HYPE),是定位于内质网的双功能酶,对分子伴侣 BiP(GRP78)进行可逆的单磷酸腺苷化修饰。未折叠蛋白反应(UPR)未激活时,FICD 对 BiP 进行单磷酸腺苷化以抑制其活性;而当内质网应激发生时,FICD 切换为去单磷酸腺苷化酶,移除 AMP 基团以恢复 BiP 的伴侣功能。人源 FICD 蛋白中Glu234位点(功能上对应于细菌 AntF的Glu28)在去单磷酸腺苷化活性中也发挥着关键的催化作用。这种从细菌到人类高度保守的“双功能”调控模式,提示我们 AntF 的发现并非孤例,而是Fic家族蛋白在进化过程中形成的一种普遍性调控策略。
经典的 TA 系统中,抗毒素通过蛋白-蛋白物理结合抑制毒素,。而 Fic-1-AntF 系统则展示了另外一种可能,抗毒素AntF兼具毒素的“保镖”(通过结合抑制毒性)和毒素的“清洁工”(通过酶活性逆转毒素对底物的损伤)双重功能,既能阻止新产生的 Fic-1 去攻击 GyrB,又能将已经发生的错误修饰“擦除”,确保 DNA 复制在环境适宜时能够顺利恢复。这一发现不仅刷新了我们对毒素-抗毒素系统作用机制的理解,也为研究多亚基酶的进化提供了重要线索——抗毒素可能通过“劫持”毒素的活性位点,演化出了新的催化功能。
引用本论文:
Chen F, Guo L, Lu C, Jiang W, Luo Z-Q, Liu J, et al. The toxin–antitoxin complex Fic-1–AntF functions as a deAMPylase that regulates the activity of DNA gyrase. mLife. 2026;1–11.
原文链接:https://doi.org/10.1002/mlf2.70085




mLife 期刊简介
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