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编辑专访系列/William (Barny) Whitman博士访谈

已有 1137 次阅读 2019-8-30 13:57 |系统分类:观点评述

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编辑专访系列/William (Barny) Whitman博士访谈

这我们全新的“编辑系列特别报道(Editor Spotlight Series的第一篇文章。关注我们每月发布的文章,了解我们的学术编辑对其自身职能的剖析以及为作者提供的建议。


William (Barny) Whitman博士是一位学术编辑,同时还是HindawiArchaea期刊的编委会成员。他于1978年在德克萨斯大学(University of Texas)获得博士学位。惠特曼博士自1993年以来曾在美国佐治亚大学(University of Georgia)担任过多个职位,如今他是佐治亚大学的微生物学杰出教授(Distinguished Research Professor of Microbiology),同时还是一名博士生导师。他积极参加外部学术交流活活动,是多个专业学会的成员。此外,他还发表过多部学术著作

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William (Barny) Whitman博士,美国佐治亚大学微生物学杰出教授。

ORCID: 0000-0003-1229-0423

在和Hindawi团队合作的最初阶段,我并不太了解Hindawi,但随着时间的推移,他们的专业精神以及他们对学术卓越的不懈追求令我印象非常深刻。

开放获取非常棒。通过它,全球任何一个读者都可以访问你的作品。综合来看,Hindawi的期刊在收费方面是相对较低的。

通过在Archaea为研究人员提供论坛的方式,该期刊帮助研究人员面向同一目标进行意见交流及合作。

 Q:您当前的研究领域是什么?

Dr.Whitman:我对能够改变地球大气的原核生物(prokaryotes)生理学(以及功能和构造)感兴趣。原核生物是一种无细胞核的单细胞微生物,如细菌和古菌(archaea)。尤其令我感兴趣的是能够产生气态甲烷的甲烷古菌甲烷球菌methanoarchaeon Methanococcus)。产甲烷作用(Methanogenesis),即甲烷生成,至今仍未得到足够的科学认知。这种厌氧呼吸形式呼吸的是二氧化碳而非氧气。由于这种呼吸形式是伴随着生命的早期历史而进行演变的,因此它具有重要意义。甲烷还是一种常见的燃料,因此理解产甲烷作用还可以推动生物技术在生物燃料生产中的应用。最后,产甲烷菌(methanogens)还代表了最原始的原核生物家族之一。因此,它们为地球生命的早期进化提供了参考。我的实验室还针对一类甲烷球菌开发了一个高质量的培养和遗传系统,因此我们有能力解决这些问题。此外,我还研究能够将二甲基巯基丙酸(Dimethylsulfoniopropionate)转化为二甲硫醚(dimethylsulfide)的海洋细菌。这种气体是大气中硫的一个主要来源。

Q:能介绍下您的背景吗?您如何成为您所在领域的研究人员?

Dr.Whitman:我最初研究的是自养细菌(autotrophic bacteria),它们可以像植物光合作用那样自产食物。在我开展有关于光合细菌(photosynthetic bacteria)的论文研究期间,一位委员会成员建议我研究产甲烷菌。当时恰逢这种古菌刚被“发现”期间,这让这个科目变得更加有趣。我的博士后研究是在伊利诺伊大学的拉尔夫·沃尔夫(Ralph Wolfe)实验室进行的。在这里我遇到了卡尔·乌斯(Carl Woese),同他深入讨论了这种古菌,此后一直投身于这个研究领域。

Q:在您的研究领域内,您认为哪个课题是最紧迫的?您对未来作过任何预测吗?

Dr.Whitman:我们对古菌的研究太过有限,以至于与此有关的每个课题都显得十分紧迫,但最近发表的未培养古菌(uncultured archaea)的宏基因组组装序列(metagenome assembled sequences)尤其令人期待。然而,就目前而言,微生物分离和培养方面似乎进展缓慢。培育微生物的能力有助于改进这种微生物的实验研究方法。而这往往可以大幅提高我们对古菌的认识水平。对于古菌而言,培养方面的问题非常常见,甚至涉及那些分离的物种。

Q:您所在的领域出现了哪些重要进展?

Dr.Whitman:基因组测序分析为我们理解古菌系统的发育提供了越来越多的支持,为此我感到非常兴奋。将这类古菌的起源归于古广菌门(Euryarchaeota)的范畴之内对其生物学研究有着重要意义。对于未培养宏基因组组装基因组(metagenome assembled genomes)而言,其甲烷生成基因的发现也同样令人感到兴奋。它揭示了此前无从知晓的发生在地球上的许多生物过程。此外,这还说明,我们需要利用更先进的微生物、生物化学和分子技术,来研究这些微生物。

Q:是什么吸引您担任Archaea期刊以及Hindawi)的学术编辑?

Dr.Whitman: 担任期刊编辑可帮助我及时了解最新的研究趋势。在并入Hindawi之前我已经是Archaea期刊的编辑了,因此当期刊进行调整后,我便成为了Hindawi的学术编辑。在和Hindawi团队合作的最初阶段,我并不太了解Hindawi,但随着时间的推移,他们的专业精神以及他们对学术卓越的不懈追求令我印象非常深刻。在我为Archaea期刊编辑过的论文中,某些论文所描述的实验都经过了精心构思和操作。这是最让我感到快乐的方面。

Q:您对开放获取有什么看法?开放获取是如何为您的研究提供帮助的?

Dr.Whitman:开放获取(Open Access)非常棒。通过它,全球任何读者都可以访问你的作品。综合来看,Hindawi的期刊在收费方面是相对较低的。将预印本作为增加新信息发布的一种方式,这种理念我很赞同。然而,我担心这会产生意想不到的负面影响,因此,我们最好对开放获取的影响进行长期评估。

Q:为什么这家期刊对其所在领域具有重要意义?它对生物学界有何意义?

Dr.Whitman:目前,Archaea对生物学界意义重大,并且对其所在的这个领域也非常重要。科学是一种基于实验结果的交流形式。可以说,科学的进步速度和科学信息的交流速度呈正比。研究是一项集体工作,因此快速和公开的交流可以惠及每一个人。举例来说,在二十世纪八十年代,我对开发甲烷古菌(methanoarchaea)基因系统非常感兴趣。尽管我的实验室取得了一些进展,但其他实验室的成功对我们的帮助却是不可估量的。对于特殊领域的研究人员而言,像Archaea这样的专业期刊是信息交流的重要平台:古菌研究人员是这一新兴领域的先锋。对于更为广泛的生物学家群体而言,尽管许多实验未能产生对其具有足够重要意义的实验结果,但能将这些结果呈献给专家,便对该领域的发展起到了推动作用,也为该领域未来的创新能力提供了保障。

尽管科学具有竞争性质,但我认为,最重要的竞争是在领域和领域之间发生的,而非领域之内。那些不能利用最先进的研究方法并无法产生具有普遍意义的研究成果的领域终将走向衰亡。那些致力于相关问题的研究人员能够完全理解他人的研究成果,并最大程度地从中获益。通过在Archaea为研究人员提供论坛的方式,该期刊帮助研究人员面向同一目标进行意见交流及合作。

除了正式发表的作品之外,作者、审稿人和编辑之间的互动也是一个重要的交流机会。所交流的信息涉及论文编写,而且在评审的过程中,有关科学假说、价值观和道德方面的观点也会得到交流。编辑和同行评审人员可以利用这个机会对我们这个领域的年轻科学家进行指导。我喜欢将此当作全球性学术圈的一个组成部分。

Q:对于那些准备撰写第一篇论文的博士研究人员,您会为他们提出哪些建议?

Dr.Whitman: 对于准备撰写一篇博士学位论文的人,我的体会是:我的母语是英语,并且我的写作时间也很长了。但这仍是一项颇具挑战性的工作。写一篇高质量的论文所需要的时间与做实验的时间不相上下,因此,抽出足够的时间是非常必要的。当你完成第一份草稿之后,反复修改十次。这并非开玩笑。当你以这种方式完成论文后,你的论文一定可以准确表达你的想法,避免词不达意的情况。

我还发现,一般不到下笔时,我不会对结果进行深思熟虑。实验台上看起来不那么重要的事情,在你落笔时就会变成非常关键的资料,因为写作会强迫你对你的结果进行深思。我在这方面表现得总是不太理想,而有些非常成功的研究人员则会在每次实验结束后写一份总结,内容包括实验基本原理和总结,以及实验方法和结果的详细描述,包括图表和表格。当他们准备着手撰写论文时,他们便开始对自己所得出的这些结果加以归纳。

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