棉花转录景观图谱的完全解析

    近期，朱玉贤院士和周宇教授等人在Nature Communications 在线发表了题为“Multi-strategic RNA-seq analysis reveals a high-resolution transcriptional landscape in cotton”的研究论文，系统地研究了二倍体棉花亚洲棉的转录景观图谱，整合了Pacbio测序、链特异性转录组测序（strand-specific RNA sequencing, ssRNA-seq）、帽分析基因表达测序（Cap analysis gene expression sequencing, CAGE-seq）和PolyA测序(PolyA-seq)等4种高通量测序技术来分析亚洲棉转录组。研究人员开发了一个IGIA数据分析流程，基于更新的亚洲棉基因组数据和多策略RNA测序数据构建精确的基因结构注释。

    本刊主编李付广研究员对该文进行了评述，认为他们的研究揭示了植物RNA转录调控的一些有趣现象和潜在的新机制，为棉花功能基因组的深入研究提供了宝贵的资源。该评述于2020年4月5日发表在Journal of Cotton Research 上。

Title: Towards complete deconstruction of cotton transcriptional landscape

Author: LI Fuguang

Journal of Cotton Research. 2020, 3: 8

https://doi.org/10.1186/s42397-020-00050-8