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怎样快速而准确地阅读科学论文(3)——引言 精选

已有 7704 次阅读 2018-7-6 11:19 |系统分类:教学心得

 

怎样快速而准确地阅读科学论文(3)——引言

 

吴崇明 中国医学科学院药用植物研究所 chomingwu@163.com

 

接上文。阅读理解了论文的标题和摘要,我们已经对整篇论文的主要内容有了整体了解,并形成了自己对论文质量,以及是否对自己的研究有参考价值的判断。如果我们认为该论文的研究质量上乘,研究方法或结果对我们自己的研究有重要参考价值,或者论文的结论很有趣味,就会想进一步阅读论文的正文。

研究论文的正文一般由引言、方法、结果与讨论等部分构成。按照顺序,我们首先读到的是论文的引言。那么引言我们该如何阅读呢?应该注意哪些细节?怎样才能通过阅读引言把握作者的写作逻辑呢?在回答这些问题之前,我们首先应该知道引言的作用是什么?作者为什么要写作引言。

一般而言,引言的目的主要有两个:(1) 告诉读者,我的研究是有价值的;(2) 让主编/编辑清楚论文的相关研究背景,确认研究内容符合期刊发表的范畴。为了实现这个目的,作者在写作引言时,通常会讲述如下几个问题:

  研究的问题/领域是什么?

  研究为什么重要?

  目前的主要研究或发现的成果?

  尚未解决的问题?或已有问题没有被科学解释清楚?

  本篇论文的研究目标和方法?即将提供什么新方法/数据/模型/理论去解决问题?

了解了作者写作引言的目的,我们只需要逐条进行解读即可。以上问题中,我们至少应该关注两点:(1) 这个工作的意义和价值何在?(2) 有哪些背景是我们读懂论文含义所必需,而我们尚未掌握的?

对于第一点,很容易理解。而对于第二点,则是我们能够读懂论文结果所需要的基础知识。由于每个人的知识背景不同,作者为了让读者能够理解论文所列举的结果数据的意义,从而能够评价和认同作者的推理逻辑,因此会把理解这些数据所需的基本概念在引言中做一交代。如果我们在阅读的时候,对这些背景都比较熟悉,则在后续的结果和讨论阅读中不会遇到太大困难,但如果发现自己对引言介绍的背景或者某些专业知识不熟悉,则需要延伸阅读一些相关背景论文,以帮助自己真正读懂这篇故事。

具体应该怎样做呢,还是以一个实例进行说明。

 

Cox LM, et al. Altering the intestinal microbiota during a critical developmental window has lasting metabolic consequences. Cell. 2014;158(4):705-721.


这是2014年发表在Cell上一篇论文。题目是:(在发育的关键期)改变肠道菌群会造成(长久)的代谢后果。主干是研究主体,括号中的修饰语是论文的关键点。从题目我们可以得知,这篇论文研究的是肠道菌群对代谢的影响,其主要关注点在于,生命早期的干预对成年以后的影响。

论文摘要的内容:肠道菌群从出生开始获取,并逐渐形成稳定的菌群结构。(发育期间)(暴露于低剂量的抗生素)破坏肠道菌群会改变宿主代谢和肥胖。我们发现,(从出生开始)给予低剂量青霉素会改变代谢和影响免疫基因的表达。(生命早期的)低剂量青霉素会(短暂)干扰菌群,但足以造成(持续的)影响,表明(婴儿时期)菌群互作对(长期)宿主代谢具有关键影响。此外,低剂量青霉素会提高高脂饮食的增肥效果,这种表型可以被(抗生素选择的微生物)转移给无菌动物,因此菌群(而非抗生素本身)发挥关键作用。这些研究表征了(生命早期微生物-宿主代谢互作)的重要变量,并鉴定了(与代谢改变相关的)菌属分类。

主干阅读可以让我们快速领会摘要的故事梗概,而括号中的修饰词是理解本篇论文创新点的关键所在。

 

下面是引言。由于引言目的是强调论文的重要性和相关背景,不需要我们读的过于深入透彻。所以,通读大概即可。主要是寻找上述的5个问题。

第一段,我们只需要看到:肥胖增加糖尿病。肠道菌群会促进肥胖。胖子和瘦子的肠道菌群不同,并且胖瘦表型能够转移给无菌动物。因此,需要对肠道菌群-宿主代谢互作有更深的理解。这段话点明了论文的研究领域——菌群-宿主代谢互作;论文的重要性——与肥胖和糖尿病密切相关。

第二段,生命早期是代谢发育的关键时期,此时的菌群改变会导致体重改变。(由剖腹产或抗生素导致的)生命早期菌群扰动伴随(儿童期)超重。但是在小鼠中,抗生素可能增加或降低体重(取决于随着剂量、饮食或菌株的不同)。这段话点明了论文的要点——生命早期菌群扰动对体重具有深远影响。

第三段,农民已经使用低剂量抗生素促进家畜生长(使用得越早效果越好)。我们曾采用这种方法研究宿主-微生物代谢关系,发现早期低剂量抗生素会增加脂肪,改变代谢激素、肝脏代谢以及菌群组成。这段话介绍了前人的研究情况。这里,我们使用低剂量青霉素干扰菌群,检查(1)限时抗生素暴露是否关键;(2)青霉素和饮食的效果是否协同;(3)改变的菌群是否足以导致代谢表型。这段话介绍了本文的研究目的和方法

第四段,停止抗生素处理后菌群结构恢复正常,但是代谢表型依然持续,所以生命早期的微生物对于生长和发育有重要意义。这段话强调了论文的最重要发现和亮点

 

可能是由于这个工作属于原创性研究,可供参考借鉴的资料很少,因此,作者并未在引言中叙述过多别人的研究情况,只是在不断强调此工作的重要性,以及开展这个研究的合理性。只要我们读懂了这篇工作的重要意义和创新之处,就足够了。



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