在NUS学VASP_Chapter_1_准备工作与前言

1. 写在最前面

        在接触了VASP这个第一性原理计算软件包一年多以后，感觉渐渐入门，期间各种小白问题，排错排bug痛苦经历，自有一段崎岖坎坷。感谢大师兄强哥以及他的教程 Learn VASP the hard way (LVTHW)，这个教程可以说是，目前网上流传的各种教程中，最实用的教程了，而且错误少，内容持续更新，还有大师兄建立的互助Q群可谓是很强大，里面各种牛人大佬带你飞，各种老司机带你开车，在群里提问，很多问题都可以得到解决。在这里分享一下大师兄科研网：

https://www.bigbrosci.com/

        至于上面提到的互助群，也在大师兄科研网里有群号，我就不在这里重复写了。不过由于大师兄的教程太过于强大和详细，我这个VASP经验系列可能就显得漏洞百出，甚至于班门弄斧，所以如果有什么不足之处，还望各位大佬不吝赐教。为了和大师兄教程有一定不同，避免大家重复学习同样的知识，所以本文主要结合自己所看所学，写一些不同于大师兄教程的经验心得，或写一些在新加坡国大能够使用到的超算资源相关的小窍门。当然很多知识点难免出现重复，不过鉴于我和强哥的友好关系，他应该不会锤我。

2. 学习资料

        既然是用VASP做密度泛函计算，那自然是要有一定的基础知识储备，否则就算是学会了，那也只能算是一个合格的软件使用者，这就是一个误区，太注重应用了。不过也有另一个误区，觉得自己理论基础不够，非要等完全掌握了量子力学+泛函分析+线性代数......等等之后才能开始做计算。那么等你开始做计算，隔壁组的师弟PhD都毕业了。所以我建议，做计算要边学理论知识，边上机操作，理论应用两手抓两手硬。这一点我是很同意Sob老师(Sobereva，国内量化计算的大牛)的看法：http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html。下面推荐一写学习资源，希望对大家有帮助。

    2.1 VASP官方手册: 

https://cms.mpi.univie.ac.at/wiki/index.php/The_VASP_Manual

        官方手册的重要性不言而喻，你所碰到的99%的问题都可以在里面找到答案。

    2.2 大师兄科研网 www.bigbrosci.com/  这个应该不用多说了

    2.3 推荐一个《量化砖头》，网上搜一下，PDF版，2007年写的，前面两部分介绍了DFT相关的理论知识，后面是VASP软件使用的教程，我很喜欢前面两部分，基础知识薄弱的同学可以好好看一眼。

    2.4 Density functional theory: A practical introduction, by David Sholl，这个书是大师兄推荐的，比较偏VASP应用，对于解决实际问题很有帮助，强烈推荐。

下面推荐几个补基础知识的课本：

    2.4 Physical Chemistry: A Molecular Approach By (author) Donald A. McQuarrie

        这本教材是我觉得适合化学背景同学看的书，从氢原子波函数求解，一路到变分、微扰、群论，虽然没有讲到DFT，但是一些基础知识里面都有涵盖。

  2.5 Molecular Quantum Mechanics By Peter Atkins。这本书偏分子系统。

  2.6 Introduction to solid state physics By Charles Kittel。VASP计算可能更偏向于固体计算，所以态密度，能带理论等等概念，都需要知道一些，还有晶体和空间群的一些基础知识。基泰尔这本固体物理对于我来说已经够用了。

  2.7 Quantum Chemistry By Ira N. Levine。其实和Atkins的内容脉络大致相同。

        我相信大多数同学和我一样，没有那么大精力仔仔细细把上面的书都好好看一遍，因为时间有限。不过只是脉络和重点的几章（基本就是每本书的前几章）至少也要弄懂吧。其实看这些书比看文献还是轻松多了的。

3. 编程

        很多人觉得一定要会编程才能做计算。但我觉得吧，也并非如此。初学者不会编程，照样可以上手。但是有一点我们绕不开，那就是使用Linux系统，我之前只用过Windows系统，所以刚开始很不习惯。为啥一定要用Linux？因为这些个计算软件包都是Linux上运行的啊，即使你使用超算，在Windows系统下用Putty进行连接对话，基本的Linux命令还是要会的，至少几年后熟练使用了ls cd cp rm 等语句，不会被别人忽悠rm -rf /*。当你熟练使用Linux系统，那么bash脚本的写作也没有那么难的了。

        关于Linux系统，大家看一看鸟哥的Linux私房菜就很有帮助。遇到需要的命令，那就网上搜一搜，现学现用。私以为计算化学的同学最应该具备的能力就是自学。

        如果想从菜鸟进阶成为计算化学大神，那么写代码的能力是不可或缺的。最流行的莫过于Python了，这个Learn Python the hard way啥的，我想大家比我都懂。还有很多大神用Fortran写后处理包，例如vaspkit，我只想说，大家有兴趣可以自学，这个我真不会教，我自己也不会啊（vaspkit是一个很强大的VASP后处理工具，已经帮助大家准备输入文件等等，后面我也会有介绍）。

4. 本文的目的

        其实我这个系列的定位是学习笔记，就是我学习VASP中的心得体会，其中难免有一些错误知识，希望大家带着批判的眼光来看这个系列笔记。

        本文面向的群体，就是像我一样，化学背景的同学们。我本人数理基础弱，刚开始也不会编程，也不懂物理，一点一点学，一点一点练，从网上找资料，向论坛大神求助。希望这个学习笔记系列可以帮到新手上路做计算的同学们。

        最后，希望我们互帮互助，共同进步。