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gwt2mat:将gwt权重文件转成n-by-n矩阵

已有 5575 次阅读 2018-6-9 10:56 |个人分类:区域经济研究|系统分类:科研笔记

 

 

  【导读】

程序gwt2matGeoDa生成的gwt格式文件转成n*n矩阵,从而可以适用于matlab空间计量经济分析程序。

 

一、gwt格式文件

GeoDa 可生成两种格式的权重文件,一为基于邻接关系的gal文件,一为基于距离远近的gwt文件。

gal文件为0-1矩阵,相邻单元赋值为1,否则为0

gwt文件计算出一定距离范围内的单元间距离。如将阈值距离设定为充分大,则可计算出所有单元两两之间的距离。

GeoDa的一个优势是,可根据单元点的经纬度坐标,计算出点与点之间的弧度距离,较之欧几里得距离更为合理。

gwt权重文件为文本格式,可用“记事本”打开。如下图所示,文件province31.gwt给出了中国31个大陆省份两两之间的距离,其第一行为文件头说明,表示有31个单元,基于shape文件Province31生成,识别单元的变量为POLY_ID。接下来共三列,第一列和第二列均为单元编号,第三列为单元间距离。如第二行表示POLY_ID值为1的单元与POLY_ID值为15的单元间距离为1.066。对于省份来说,距离计算的坐标为其质心经纬度。

 

二、R语言程序gwt2mat

利用R语言spdep包中的read.gwt2nb,可以读入将gwt数据读为nb对象。然后再利用nb2mat,可以将其转成n*n矩阵,然而这是0-1矩阵,且默认为行标准化,偏离我们的预期。

现自编R语言程序gwt2mat()gwt文件转成n*n矩阵,其参数设定如下:

gwt2mat(gwt)

其中,gwt为文件路径。生成后,自己可以进行取距离平方倒数后的行标准化。

后面会专门开发函数swm.rownorm来进行各种情况下的行标准化。

代码

#设置为自己的工作文件夹

> setwd("…\\20180526gwt权重文件转成n-by-n矩阵\\gwt2mat")

#spdep包中的函数处理,偏离预期

> library(spdep)

> spmat1 <-   read.gwt2nb("province31.gwt")

Warning message:

In read.gwt2nb("province31.gwt") :   region.id not named POLY_ID

#nb2mat转成矩阵,所有非零元素均为0.03,达不到预期效果

> spmat1 <- nb2mat(spmat1)

#gwt2matgwt权重文件转为n*n矩阵

> source("gwt2mat.R")

> spmat2 <-   gwt2mat("province31.gwt")

Read 2790 items

#spmat矩阵元素取平方倒数,再行标准化

> spmat2 <- apply(spmat2, 1,   function(x) {

+   x[x   != 0] <- 1 / (x[x != 0])^2

+     return(x / sum(x))

+ })

> spmat2 <- t(spmat2)

#写出n*n空间权重矩阵

> write.csv(spmat2, "spmat.csv")

 

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