T1像Freesurfer预处理，确定感兴趣脑区（ROI）。 

Mrtrix3.0，根据扫描参数，single-shell data 建议使用Single-Shell 3-Tissue CSD (SS3T-CSD)，参见https://3tissue.github.io/doc/ss3t-csd.html；multi-shell data建议使用Multi-Shell Multi-Tissue Constrained Spherical Deconvolution (MSMT-CSD)，参见https://mrtrix.readthedocs.io/en/latest/constrained_spherical_deconvolution/multi_shell_multi_tissue_csd.html。本人分析数据为single-shell data。

Mrtrix3.0分析过程Mrview查看和可视化。

参考数据扫描参数和既往研究，确定fiber tracking tckgen参数。

pyAFQ clean bundle后处理，参数调整，可根据既往研究及相关资料调整；本人实践调整参数有distance_threshold，length_threshold；参见https://yeatmanlab.github.io/pyAFQ/autoapi/AFQ/segmentation/index.html。

Mrtrix3.0 tckstats对streamline统计描述，长度平均值、标准差、中位数等。可参考https://programmer.ink/think/61486d72576e9.html。