李翀的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/lichong428 中国科学院生物物理研究所

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【原创】Aging:膀胱癌干细胞非编码RNA表达谱

已有 2006 次阅读 2020-2-21 20:48 |系统分类:论文交流

Aging发表了中国科学院生物物理研究所李翀博士与深圳大学的联合研究成果。研究发现,膀胱癌干细胞(BCSC)具有自我更新和分化的能力,促进了膀胱癌的发生,转移,复发和耐药性。我们分选到了膀胱癌标本中的膀胱癌干细胞(BCSC)和非干细胞(BCNSC),进行转录组微阵列数据分析,比较了BCSC与BCNSC中的mRNA、lncRNA和circRNA差异表达。发现CircRNA_103809在BCSC中显著高表达,它能够吸附miR-511来促进膀胱癌的自我更新、迁移和侵袭能力。通过GO和KEGG进一步分析,我们获得了ncRNA/mRNA和circRNA/mRNA共表达网络的调控模式。作为网络核心基因,AHCY、C6orf136和LRIG1在膀胱癌预后中具有极高的应用价值。

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图1. 膀胱癌干细胞mRNA,lncRNA和circRNA分析流程



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