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Pymol获得蛋白中二级结构信息

已有 2098 次阅读 2018-4-18 16:42 |系统分类:科研笔记

 open("d:/secondary.txt","w").writelines( ["Residue %s: %s\n"%(a.resi,a.ss) for a in cmd.get_model("protein-name" +" and n. ca").atom] )


其中protein-name需要替换成序列名称,结果会保存到d:/secondary.txt



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