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Nature:生长素响应因子A型ARFs的转录调控网络

已有 597 次阅读 2020-11-20 08:58 |个人分类:每日摘要|系统分类:论文交流

A network of transcriptional repressors modulates auxin responses

第一作者Jekaterina Truskina

第一单位法国里昂大学

通讯作者Teva Vernoux


 Abstract 


大背景The regulation of signalling capacity, combined with the spatiotemporal distribution of developmental signals themselves, is pivotal in setting developmental responses in both plants and animals.


小背景:The hormone auxin is a key signal for plant growth and development that acts through the AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF) transcription factors. A subset of these, the conserved class A ARFs, are transcriptional activators of auxin-responsive target genes that are essential for regulating auxin signalling throughout the plant lifecycle.


提出问题:Although class A ARFs have tissue-specific expression patterns, how their expression is regulated is unknown.


结果1-染色质修饰与可及性:Here we show, by investigating chromatin modifications and accessibility, that loci encoding these proteins are constitutively open for transcription.


结果2-转录调控因子鉴定:Through yeast one-hybrid screening, we identify the transcriptional regulators of the genes encoding class A ARFs from Arabidopsis thaliana and demonstrate that each gene is controlled by specific sets of transcriptional regulators.


结果3-转录抑制作用:Transient transformation assays and expression analyses in mutants reveal that, in planta, the majority of these regulators repress the transcription of genes encoding class A ARFs.


结论:These observations support a scenario in which the default configuration of open chromatin enables a network of transcriptional repressors to regulate expression levels of class A ARF proteins and modulate auxin signalling output throughout development.


 摘  要 


在动植物中,信号转导能力的调控与发育信号的时空分布一起,在决定发育响应过程中发挥重要作用。植物激素生长素是植物生长和发育的一个关键信号,其通过生长素响应因子ARF转录因子蛋白发挥作用。ARFs中的一个亚类A型ARFs是响应生长素靶基因的转录激活因子,在植物整个生命周期中调控生长素的信号转导都是必不可少的。尽管A类ARFs具有组织特异性的表达模式,但是这些ARFs的表达调控机制还不清楚。本文中,作者通过染色质修饰和可及性研究发现,编码A类ARFs的位点具有组成型的染色质开放特征,提供了可被转录的基础。通过酵母单杂筛选,作者鉴定了拟南芥中A类ARFs的转录调控因子,并且发现每个A类ARFs基因的表达都是由特定的转录调控因子集所调控的。瞬间转化试验和突变体表达分析发现,在植物体内作者所鉴定到的大多数调控因子都是起抑制A类ARFs编码基因表达的作用的。本文的研究发现在拟南芥中,A类ARFs编码位点的染色质开放特征为其表达上的转录抑制调控网络提供了前提,从而在发育过程中调控生长素的信号转导输出。


 通讯作者 

**Teva Vernoux**


个人简介:

2002-2005,杜克大学,博士后。


研究方向:植物激素如何作用于植物的器官发生


doi: 10.1038/s41586-020-2940-2


Journal: Nature

Published online: Nov 18, 2020



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