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Mothur的安装

已有 11430 次阅读 2015-4-16 19:16 |个人分类:工具mothur|系统分类:科研笔记| style, Microsoft, 微软雅黑, 编译器, 下载安装

第一、下载安装包安装
   1、针对Mac OSX环境,须有c++编译器
       (1)安装包的下载
       (2)解压:  unzip mothur.zip
       (3)进入目录:  cd mothur
       (4)编译:   make
       (5)验证编译是否成功:  ./mothur 查看是否运行成功,用quit()退出
   
   2、针对Linux环境,须有c++编译器
       (1)安装包的下载
       (2)解压: unzip mothur.zip
       (3)进入目录: cd mothur
       (4)编译: make
       (5)验证编译是否成功:./mothur 查看是否运行成功,用quit()退出
       在Linux的安装中,可能会遇到readline的问题,此时:
       1)如果是编译时遇到readline的问题,可以尝试安装 ncurses and readline development librarie
           对于ubuntu:sudo apt-get install libreadline-dev libreadline5-dev
           对于 RedHat / Centos :yum install readline-devel nucrses-devel 
       2)其他问题可参考http://www.mothur.org/wiki/How_to_Resolve_Readline_Issues
第二、GitHub上下载
       https://github.com/mothur/mothur/releases
   经mac测试,下载后直接可以用,不需要安装
   相关详细材料,可参考http://www.mothur.org/wiki/Installation




https://blog.sciencenet.cn/blog-306699-882982.html


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