按照https://docs.qiime2.org/2017.7/tutorials/moving-pictures/的说明，在Linux环境下使用QIIME2，途中遇见各种问题的解决方案

1）qiime demux summarize --i-data demux.qza --o-visualization demux.qzv出现如下报错信息

   解决方案1：https://forum.qiime2.org/t/error-in-qiime-feature-table-summarize/308

   解决方案2：由于个人是利用windows登陆服务器，为此下载Xming，在putty中对登陆节点进行localhost:0的设置

   重新运行后，出现如下结果

   此处注意，用解决方案1不能使用命令

qiime tools view demux.qzv

  用解决方案2，用此命令查看数据时，出现一些报错信息，但不影响结果查看

2）qiime dada2 denoise-single --i-demultiplexed-seqs demux.qza --p-trim-left 0 --p-trunc-len 120 --o-representative-sequences rep-seqs-dada2.qza --o-table table-dada2.qza

   此步在利用qiime的全路径运行时，没有在source activate qiime2的环境下（/home/xiaob/miniconda3/envs/qiime2-2017.6/bin/qiime dada2 denoise-single --i-demultiplexed-seqs demux.qza --p-trim-left 0 --p-trunc-len 120 --o-representative-sequences rep-seqs-dada2.qza --o-table table-dada2.qza ），出现报错信息如下

   为此报错google查了很长时间，没有找到明确的解决方案，尝试在source activate qiime2的环境下运行，顺利得到结果

3）qiime feature-classifier classify-sklearn --i-classifier gg-13-8-99-515-806-nb-classifier.qza --i-reads rep-seqs.qza --o-classification taxonomy.qza，出现报错信息如下

scikit-learn的版本不一样，个人的解决方案是重新将qiime-2017.6更新为qiime-2017.7，重新运行

4)qiime feature-classifier classify-sklearn --i-classifier gg-13-8-99-nb-classifier.qza --i-reads rep-seqs.qza --o-classification taxonomy.qza，出现报错信息如下:

TypeError: _futuristic_archive_error() takes 2 positional arguments but 3 were given

检索QIIME2的论坛，https://forum.qiime2.org/t/save-a-feature-classifier-properly/1639

提示这是2017.7版的bug，为此删除2017.7版，更新安装2017.12，此错误得以解决。

5）利用2017.12运行qiime feature-classifier classify-sklearn --i-classifier gg-13-8-99-nb-classifier.qza --i-reads rep-seqs.qza --o-classification taxonomy.qza，出现报错信息如下：

OSError: [Errno 28] No space left on device

检索QIIME2的论坛，https://forum.qiime2.org/t/no-space-left-on-device-for-qiime-feature-classifier/2122

提示需要指定个空间足够的temp目录，为此export TMPDIR=* 设定个环境变量，重新运行，此错误得以解决。