生物技术创新创业分享 http://blog.sciencenet.cn/u/SNPs 美国HudsonAlpha研究院的研究员。做分子鉴别诊断平台技术的开发和免疫组库基础科研。

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高通量测序:不再问“怎么测?”,开始问“测什么?”

已有 6530 次阅读 2011-3-8 01:56 |个人分类:生物技术创新创业|系统分类:科研笔记| 生物技术, 创新创业

今天信箱里收到邀请,参加秋天的一个有关高通量测序的会议:

最近这类的会议越来越多了。也是,当高通量测序的价格大幅度下降了以后,大家的问题已经变了,不再是“如何测序?”而改成“测什么才有临床意义?”

假设我们今天就能用$100元做全基因组测序了,你测什么基因才最有临床价值?这是许多生物技术公司试图回答的问题。我们HudsonAlpha研究院的大楼里最近就新开了一家公司专门做临床测序应用的(我微博里有介绍)。上个星期他们公司做了介绍:


Kailos (健康的意思)的首打产品是做影响癌症病人药物代谢的遗传多态位点。这是一个非常好的应用,简洁明了,技术成熟,市场容易接受,测序也较其它方法有优越性,他么选择的市场模式(临床参比实验室)也很对路。技术方面,他们得到了Patch-PCR的独家使用权,这是一个同时扩增很多基因组位点的好方法。因为标本是病人血液,可以得到大量高质量的DNA, 所以敏感度不是问题(这个方法做感染性疾病诊断可能就不够敏感了,也太麻烦了)。

我们iRepertoire也是试图回答“测什么”的问题。我认为免疫组库测序和许多疾病的关系更密切。测基因组DNA试图了解“遗传因素”对疾病的影响;而测免疫组库则是去分析“环境因素”对疾病的影响。两者应该是兼顾的。

人生病就好比车坏了,是出厂时就有潜在问题(基因组测序)?还是使用过程中出了问题(免疫组库测序)?


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