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对基因组序列进行模拟酶切(电子酶切)的Perl包(module)

已有 3494 次阅读 2017-3-17 09:53 |个人分类:生物信息工具|系统分类:科研笔记| 简化基因组技术, 模拟酶切

   GBS或者RAD技术可简化基因组序列,在群体基因型鉴定、进化分析中应用广泛。而选择合适的限制性内切酶是此技术的关键步骤。RestrictionDigest是一款功能强大的、进行基因组序列模拟酶切的工具,可模拟单酶切和双酶切,可处理较大基因组(2.7 G bp),可列出不同长度片段所占比例。

   详细介绍见http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S071734581630001X;

    软件下载见https://github.com/JINPENG-WANG/RestrictionDigest.




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