本文所附PDF文件中在Windows编译r8s部分已经过时，请参考博文：

《怎样在Windows10系统中编译和运行r8s》

http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1144730.html 

r8s是美国加利福尼亚大学戴维斯分校的进化生物学家Mike Sanderson编写的用于估算进化树分化时间的软件，在进化生物学、分子生物地理学等学科有着广泛的应用，已经成为估算分化时间不可或缺的软件之一。该软件中的一些方法如NPRS和PL是软件作者最先提出的，目前在同类的其他软件中还难以实现。R8s的运行平台为MacOS和Linux，在国内应用的还不多，也难以找到中文的练习资料和说明。

本文基于当前版本r8s 1.7.1，参照其说明书，介绍该软件在Windows下的安装和操作，并对其模块的功能和选项进行简要的说明。

 r8s使用指南 完整版