新发现：nidoviruses中存在一个具有核苷酸化活性结构域

本文是阅读“Lehmann K C, Gulyaeva A, Zevenhovendobbe J C, et al. Discovery of an essential nucleotidylating activity associated with a newly delineated conserved domain in the RNA polymerase-containing protein of all nidoviruses[J]. Nucleic Acids Research, 2015, 43(17):8416-8434.”的读后感，作者：侯彭姣

巢式病毒目病毒属于正链RNA 病毒，包括4个科，分别为Coronaviridae、Arteriviridae、Mesoniviridae、Roniviridae。它们既可以感染哺乳动物和少数禽类，也可以感染无脊椎动物。2003年爆发的SARS和2012年爆发的中东呼吸综合征均是由冠状病毒引起的。RNA病毒通过编码RdRp催化合成病毒RNA. Nidoviruses基因组属于多顺反子，其转录和翻译依赖由自身合成的一系列非结构蛋白与少数未知的宿主蛋白形成的转录/复制复合物（RTC）完成。RNA病毒通过编码RdRp催化合成病毒RNA。RdRp作为RTC的核心组分之一，在整个Nidoviruses中具有很高的保守性。

本文作者通过生物信息技术发现了一个新的结构域，该结构域位于RdRp结构域上游，与RdRp结构域位于同一亚基，且该结构域仅存在于Nidoviruses中，具有高度的保守性。因此该结构域可以作为Nidoviruses的第二遗传标记物。基于对该结构域的保守性分析，推测其具有核苷酸化活性（nucleotidylation activity）。作者又结合一系列的生化试验和反向遗传学方法验证了这一推测，他以EAV 的NSP9为研究对象，证明了其确实具有依赖Mn离子的核苷酸化生物学活性，它上面的赖氨酸和组氨酸可以与UTP/GTP上的a磷酸发生共价结合。这个被新确定的结构域被命名为nidovirus RdRpassociated nucleotidyltransferase (NiRAN )。利用反向遗传学实验将NiRAN的核心氨基酸突变为丙氨酸后，大大降低了该结构域的核苷酸化活性，且降低了病毒的滴度和对细胞的感染效力。以上这些实验说明 NiRAN 对nidoviruses是很重要的.它可能参与到核酸连接，mRNA的加帽过程中，但是其具体参与的生物过程还需要进一步的研究。