2003年在伦敦举办庆祝沃森-克里克提出的DNA双螺旋50周年之际，有人觉得生物医学模式的医疗实践中缺乏“分子生物学”的内容，于是“分子生物学+医学“ 就合成了"分子医学"这个分支学科。本质上，分子医学是分子生物学与医学的合成，但是“分子生物学”这个学科真正涉略的领域实在有很多不同的理解，我在《现代分子生物学教程》（2009年版，科学出版社）的有关部分对分子生物学-生物化学，分子生物学与遗传学（包括分子遗传学)等生物学学科的“领域”进行了划分。显然，生物化学主要关注“物质代谢”和能量代谢”及与这些代谢密切有关的“酶学”的结构与功能的研究，而分子生物学的定位主要是遗传物质DNA的结构与功能及DNA所负载的“遗传信息”和“基因环境互作”为重点的“表观遗传信息”，很遗憾，当今的分子生物学科上不能准确定义“基因”，包括基因的“结构实体”和“功能实体”，特别是基因的“功能实体”，包括基因的上遗传信息的编码，表达和调控等等。这些也正是现代分子生物学重点研究的内容。

在这样一个大的学科背景下，把“分子医学”进行精准定位也变得很难！但是“分子生物学”离不开“基因”这点具有国际共识，因此，最初一提到“分子医学”大家就会想到“肿瘤”和“癌症”过程中的“癌基因”和“抑癌”基因，当然，后来又扯进了与细胞死亡（凋亡、自噬、坏死等等各类死亡）的基因及其调控基因，再后来就是揭示了非编码RNA等在基因表达调控中的重要作用，因此从分子水平上看，分子医学研究的实体对象应该是“基因”不会有大的问题。

但是，很多人理解“分子医学”是把“分子”理解为“定语”，修饰“医学”，实际上从整个学科上看，则应该反过来，应该是”医学“修饰”分子“，当然这里的”分子“应该是”分子生物学“的简称而已，因此，所谓的分子医学在很多情况下应该是”医学分子生物学“，或”医学问题的基因基础“

这样理解大致反应了很多人的意思，也体现了当今有关研究的大致情形。即基于医学/疾病进行分子生物学研究。

这也是我后来在写《基因疾病的分子生物学》之时遇到的一个学科问题。

我觉得，理想的”分子医学“应该是其中的“分子”和“医学”呈并列关系，即“分子生物学”（基因）和“医学”（疾病病理或疾病的分子病理）和“分子诊断”（基因诊断）的联姻。

这样能真正体现2003年提出“分子医学”这个学科名词的本意，即把分子生物学与医学“整合”，向着更加“精准”的病理、药理和诊断聚集，以便最终出现“精准医学”这样一种医疗水平或状态。

当前，美国已经进入到这样一个状态。这个状态的促成也多亏了“组学”的助力，包括基因组学、疾病基因组学、环境基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白组学等等。

我国在这些“大工程”方面一直是“协同”欧美开展工作，最近宣布的10万中国人的基因组学(该项目由来自哈尔滨工业大学、复旦大学、中科院北京基因组研究所、华中科技大学、上海生科院的等单位团队承担，计划在四年内完成)也只是一个开端...

（意识流写作，未加任何修改）